93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1020 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  558  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  98.18 
 
 
274 aa  551  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  97.45 
 
 
274 aa  548  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  89.01 
 
 
283 aa  478  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  75.88 
 
 
272 aa  409  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  62.83 
 
 
280 aa  353  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  59.25 
 
 
278 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  56.3 
 
 
275 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  56.13 
 
 
279 aa  326  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  57.79 
 
 
284 aa  322  3e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  54.35 
 
 
282 aa  322  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  58.17 
 
 
284 aa  322  6e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  58.43 
 
 
276 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  55.68 
 
 
281 aa  308  9e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  54.34 
 
 
279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  59.44 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  53.96 
 
 
280 aa  305  4.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  61.07 
 
 
265 aa  305  4.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  53.96 
 
 
268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  53.33 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  52.38 
 
 
276 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  52.69 
 
 
276 aa  301  6.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  51.71 
 
 
286 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  55.87 
 
 
296 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  52.08 
 
 
277 aa  293  3e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  49.25 
 
 
278 aa  291  8e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  50 
 
 
277 aa  290  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  52.55 
 
 
292 aa  277  1e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  49.06 
 
 
279 aa  277  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  52.83 
 
 
283 aa  276  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  49.25 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  51.22 
 
 
301 aa  250  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  42.64 
 
 
272 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  28.36 
 
 
350 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  34.69 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  24.51 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  32.97 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  40.21 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  31.96 
 
 
293 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  36.67 
 
 
328 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  33.7 
 
 
330 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  27.44 
 
 
336 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  32.23 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  32 
 
 
338 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  23.58 
 
 
354 aa  51.6  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  25.6 
 
 
338 aa  51.6  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  41.27 
 
 
828 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  37.7 
 
 
620 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  45.28 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  45.9 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  23.11 
 
 
349 aa  47.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  35.62 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  39.33 
 
 
347 aa  47.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  30 
 
 
283 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  42.37 
 
 
247 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  28.57 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  27.12 
 
 
368 aa  45.8  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  27.12 
 
 
368 aa  45.8  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  44.07 
 
 
684 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  44.07 
 
 
683 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  44.07 
 
 
684 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  32.22 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0639  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.19 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  37.97 
 
 
447 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0193  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.29 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116765  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  33.33 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  30 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  26.13 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  30.6 
 
 
640 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  34.38 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  31.11 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  37.97 
 
 
356 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.33 
 
 
633 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  30.6 
 
 
671 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  33.33 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.57 
 
 
323 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4476  hypothetical protein  38.6 
 
 
70 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  29.67 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.72 
 
 
640 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  37.29 
 
 
689 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  40.68 
 
 
1156 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  28.74 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  40.68 
 
 
651 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.5 
 
 
326 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  30.49 
 
 
669 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  40.68 
 
 
651 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  24.86 
 
 
587 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  38.81 
 
 
282 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.72 
 
 
629 aa  42.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  24.47 
 
 
590 aa  42.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  33.33 
 
 
633 aa  42.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  28.79 
 
 
265 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>