79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0202 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  100 
 
 
283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  59.49 
 
 
283 aa  328  6e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  57.66 
 
 
284 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  58.03 
 
 
284 aa  324  8.000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  54.87 
 
 
278 aa  318  6e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  57.78 
 
 
274 aa  315  5e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  61.48 
 
 
283 aa  315  6e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  56.41 
 
 
274 aa  315  8e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  54.81 
 
 
280 aa  311  7.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  56.67 
 
 
274 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  57.78 
 
 
279 aa  310  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  54.55 
 
 
280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  54.48 
 
 
277 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  54.65 
 
 
275 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  53.99 
 
 
282 aa  298  7e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  54.17 
 
 
276 aa  298  9e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  58.27 
 
 
272 aa  297  1e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  54.65 
 
 
279 aa  295  8e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  57.72 
 
 
265 aa  293  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  54.34 
 
 
268 aa  293  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  51.29 
 
 
281 aa  292  4e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  51.09 
 
 
276 aa  291  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  51.85 
 
 
277 aa  288  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  51.09 
 
 
286 aa  287  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  51.64 
 
 
297 aa  286  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  54.05 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  52.04 
 
 
269 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  54.12 
 
 
296 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  49.45 
 
 
278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  47.71 
 
 
276 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  50.39 
 
 
301 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  49.25 
 
 
279 aa  256  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  41.31 
 
 
272 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  30.09 
 
 
350 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  29.56 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  27.94 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  28.3 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  33.66 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  28.24 
 
 
828 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  24.87 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  26.47 
 
 
354 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  23.94 
 
 
349 aa  53.5  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  23.27 
 
 
258 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  34.83 
 
 
338 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  25.56 
 
 
328 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  23.43 
 
 
336 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  23.47 
 
 
338 aa  49.7  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  40.26 
 
 
447 aa  49.7  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  21.79 
 
 
354 aa  49.3  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  29.68 
 
 
244 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  28.57 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  28 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  30.12 
 
 
620 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  25.17 
 
 
290 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.18 
 
 
325 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  33.75 
 
 
216 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  28.85 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.34 
 
 
587 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.53 
 
 
605 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  30.77 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0654  peptidase S49  23.61 
 
 
536 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.900238  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.56 
 
 
613 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  32.56 
 
 
612 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.74 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  37.29 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  31.58 
 
 
608 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.89 
 
 
585 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.56 
 
 
613 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.92 
 
 
620 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.03 
 
 
633 aa  42.7  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1326  hypothetical protein  31.88 
 
 
388 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0098  signal peptide peptidase SppA, 36K type  22.37 
 
 
313 aa  42.7  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.14 
 
 
590 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2084  signal peptide peptidase  22.37 
 
 
313 aa  42.7  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  36.71 
 
 
356 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.4 
 
 
640 aa  42.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.23 
 
 
621 aa  42.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.38 
 
 
547 aa  42.4  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  32.91 
 
 
621 aa  42.4  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>