84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0678 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  551  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  58.49 
 
 		 280 aa  318  3.9999999999999996e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  58.65 
 
 		 275 aa  311  4.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  59.12 
 
 		 282 aa  305  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  58.49 
 
 		 279 aa  305  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  57.95 
 
 		 286 aa  301  8.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  56.6 
 
 		 278 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  58.08 
 
 		 278 aa  296  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  57.69 
 
 		 279 aa  294  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  60.77 
 
 		 277 aa  293  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  53.64 
 
 		 284 aa  291  5e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  57.31 
 
 		 280 aa  291  8e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  53.64 
 
 		 284 aa  290  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  54.79 
 
 		 276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  54.72 
 
 		 297 aa  285  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  53.44 
 
 		 269 aa  285  7e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  49.81 
 
 		 274 aa  279  4e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  49.06 
 
 		 274 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  56.15 
 
 		 281 aa  276  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  54.44 
 
 		 283 aa  275  6e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  53.21 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  48.68 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  50 
 
 		 268 aa  271  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  55.74 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  53.82 
 
 		 277 aa  267  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  49.8 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  49.43 
 
 		 283 aa  265  7e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  53.76 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  53.82 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  53.54 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  51.76 
 
 		 292 aa  248  5e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  50.2 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  38.04 
 
 		 272 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  31.15 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  33.57 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4476  hypothetical protein  53.45 
 
 		 70 aa  68.9  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  28.05 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  28.1 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  27.62 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  38.14 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  26.21 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  24.44 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  32.93 
 
 		 458 aa  52.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  27.22 
 
 		 338 aa  52.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  28.57 
 
 		 828 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1326  hypothetical protein  35.54 
 
 		 388 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  29.47 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  32.35 
 
 		 244 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  37.29 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  35.94 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1235  peptidase S49  39.39 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  39.39 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0841  hypothetical protein  32.82 
 
 		 394 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  35 
 
 		 447 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  40.54 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  36.99 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  35.62 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  21.88 
 
 		 351 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0725  peptidase S49  36.99 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  38.46 
 
 		 287 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  33.33 
 
 		 216 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  21.65 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  43.1 
 
 		 620 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  36.99 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  33.66 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  29.67 
 
 		 423 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  30.77 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  31.52 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  36.36 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  38.46 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  27.83 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  31.52 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  32.61 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  35.14 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2589  peptidase S49  37.88 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901075  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  39.73 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  30.49 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  32.2 
 
 		 436 aa  42.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  25 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  21.56 
 
 		 351 aa  42.7  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  28.17 
 
 		 368 aa  42.7  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  28.17 
 
 		 368 aa  42.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.68 
 
 		 311 aa  42.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1217  peptidase S49  40.68 
 
 		 299 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>