44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4681 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  693    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  34.83 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  23.86 
 
 		 258 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  26.92 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  29.38 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  30.06 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  26.02 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  33.71 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  30.77 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  29.94 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  24.49 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  27.23 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  34.48 
 
 		 272 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  31.21 
 
 		 275 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  24.04 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  35.78 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  34.07 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  34.41 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  32.17 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  34.41 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  35.92 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  27.85 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  31.47 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  24.41 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  34.83 
 
 		 283 aa  53.1  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  32.97 
 
 		 286 aa  52.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  36.25 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  32.74 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  27.22 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  32 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  32 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  33.33 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  31.25 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  33.33 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  34.41 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  31.87 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  33.33 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  36.25 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  31.18 
 
 		 272 aa  49.3  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  31.87 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  24.58 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  33.75 
 
 		 276 aa  46.2  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  33.33 
 
 		 339 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>