109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0404 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  100 
 
 
280 aa  569  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  83.15 
 
 
279 aa  482  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  66.17 
 
 
275 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  66.79 
 
 
282 aa  371  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  69.06 
 
 
279 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  65.69 
 
 
286 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  62.55 
 
 
280 aa  355  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  64.59 
 
 
276 aa  348  7e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  60.89 
 
 
278 aa  347  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  59.93 
 
 
297 aa  344  8e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  61.9 
 
 
277 aa  344  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  62.17 
 
 
276 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  56.83 
 
 
284 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  56.47 
 
 
284 aa  332  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  60.3 
 
 
278 aa  331  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  61.13 
 
 
277 aa  330  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  58.78 
 
 
268 aa  328  8e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  58.12 
 
 
281 aa  325  7e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  65.04 
 
 
296 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  60 
 
 
276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  54.34 
 
 
274 aa  306  3e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  53.96 
 
 
274 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  55.09 
 
 
269 aa  304  8.000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  54.37 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  55.81 
 
 
283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  54.55 
 
 
272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  58.21 
 
 
283 aa  296  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  59.26 
 
 
265 aa  296  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  55.6 
 
 
283 aa  294  1e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  57.31 
 
 
279 aa  291  8e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  57.59 
 
 
292 aa  290  1e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  52.55 
 
 
301 aa  259  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  42.58 
 
 
272 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  30.85 
 
 
350 aa  108  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  29.94 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  32.96 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  27.78 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  43.94 
 
 
339 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  31.13 
 
 
323 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  25.42 
 
 
328 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  33.33 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4476  hypothetical protein  49.23 
 
 
70 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  25.78 
 
 
338 aa  55.8  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  28.66 
 
 
620 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  24.69 
 
 
336 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  33.33 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  39.13 
 
 
447 aa  50.4  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1326  hypothetical protein  36.62 
 
 
388 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  37.5 
 
 
407 aa  49.3  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  31.63 
 
 
354 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  39.71 
 
 
216 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  36.49 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  40.68 
 
 
684 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  40.68 
 
 
683 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  40.68 
 
 
684 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  29.6 
 
 
244 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  35.14 
 
 
368 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  35.14 
 
 
368 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  23.68 
 
 
354 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  28.66 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.07 
 
 
325 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  47.37 
 
 
361 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  30.88 
 
 
458 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  37.29 
 
 
689 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  30.63 
 
 
306 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0102  S49 family peptidase  35.48 
 
 
326 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  23.16 
 
 
349 aa  46.2  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  32 
 
 
640 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  32 
 
 
668 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  32 
 
 
669 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  34.92 
 
 
828 aa  45.8  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  32.97 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  32 
 
 
671 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0059  peptidase S49, SppA  32.43 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0430254  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.97 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0193  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.04 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116765  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  30 
 
 
608 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  32.2 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.83 
 
 
633 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  38.98 
 
 
1156 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  26.92 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.33 
 
 
584 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  35.59 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  35.59 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  32.63 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  38.98 
 
 
651 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  38.98 
 
 
651 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0639  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.04 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0841  hypothetical protein  32.08 
 
 
394 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  34.83 
 
 
633 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.63 
 
 
324 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0391  protein of unknown function DUF107  42.86 
 
 
452 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0830  hypothetical protein  28.12 
 
 
410 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  33.78 
 
 
283 aa  43.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  32.86 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  35.14 
 
 
688 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.46 
 
 
621 aa  43.5  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  40.68 
 
 
237 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  35.44 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  35.59 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>