116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0830 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0830  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  792    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0841  hypothetical protein  38.2 
 
 
394 aa  158  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0308  hypothetical protein  41.69 
 
 
386 aa  145  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1326  hypothetical protein  37.36 
 
 
388 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  27.99 
 
 
456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  25.71 
 
 
437 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  29.2 
 
 
437 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  25.92 
 
 
496 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  26.76 
 
 
463 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  27.13 
 
 
429 aa  106  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  27.09 
 
 
454 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  26.95 
 
 
453 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  27.23 
 
 
436 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  28.8 
 
 
472 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  30.1 
 
 
439 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  28.04 
 
 
489 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  30.02 
 
 
430 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  25.06 
 
 
464 aa  99.8  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  26.67 
 
 
443 aa  100  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  24.8 
 
 
510 aa  99.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  28.04 
 
 
447 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  27.29 
 
 
438 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  25 
 
 
458 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  28.47 
 
 
455 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  27.59 
 
 
425 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  29.5 
 
 
423 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  26.62 
 
 
472 aa  93.2  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  25.18 
 
 
464 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  26.4 
 
 
470 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  24.53 
 
 
458 aa  90.9  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  26.97 
 
 
458 aa  90.5  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  25.53 
 
 
491 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  25.29 
 
 
459 aa  89  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  28.44 
 
 
433 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  27.15 
 
 
470 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  24.4 
 
 
462 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  26.01 
 
 
446 aa  87.4  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  26.17 
 
 
560 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  24.08 
 
 
451 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  26.17 
 
 
503 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  28.51 
 
 
481 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  28.15 
 
 
488 aa  84  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  27.51 
 
 
471 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  25.73 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  26.62 
 
 
501 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1572  hypothetical protein  24.43 
 
 
498 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  25.91 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  25.9 
 
 
501 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  27.34 
 
 
471 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  28.23 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  26.94 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  26.08 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  26.17 
 
 
557 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  25.39 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  27.87 
 
 
472 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  28.67 
 
 
443 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  24.59 
 
 
501 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  27.32 
 
 
453 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  27.86 
 
 
448 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  28.3 
 
 
473 aa  76.6  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  27.49 
 
 
448 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  26.1 
 
 
453 aa  76.6  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  25.55 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  29.31 
 
 
452 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  27.93 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  26.48 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  27.57 
 
 
467 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  25.24 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  24.4 
 
 
525 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  28.47 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  24.21 
 
 
501 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  25.12 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  26.81 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1056  hypothetical protein  25.41 
 
 
438 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.919893 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  25.36 
 
 
424 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  22.75 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  27.25 
 
 
546 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  27.48 
 
 
522 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  28.05 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  25.63 
 
 
465 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  28.43 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  29.28 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  25.22 
 
 
524 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  24.62 
 
 
519 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  24.62 
 
 
519 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  24.66 
 
 
436 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  23.9 
 
 
528 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  24.31 
 
 
508 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  22.65 
 
 
525 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0068  hypothetical protein  23.06 
 
 
454 aa  64.7  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  26.91 
 
 
443 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0553  putative lipoprotein  27.96 
 
 
443 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2190  hypothetical protein  25.52 
 
 
468 aa  63.2  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  25.88 
 
 
424 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  24.34 
 
 
516 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1515  hypothetical protein  24.81 
 
 
486 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.331785  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1023  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  23.93 
 
 
529 aa  59.7  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  22.15 
 
 
447 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  25.35 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0020  hypothetical protein  24.89 
 
 
488 aa  57  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0144278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>