54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2112 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  707    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  32.27 
 
 
279 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  31.21 
 
 
280 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  30.85 
 
 
280 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  34.33 
 
 
278 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  30.04 
 
 
268 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  32.17 
 
 
277 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  33.19 
 
 
286 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  36.19 
 
 
292 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  29.15 
 
 
296 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  32.74 
 
 
284 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  33.5 
 
 
279 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  32.84 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  31.15 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  32.43 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  34 
 
 
282 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  32.74 
 
 
284 aa  97.4  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  33.01 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  35.03 
 
 
275 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  30.55 
 
 
281 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  30.09 
 
 
283 aa  94.7  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  34.87 
 
 
283 aa  92.8  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  33.33 
 
 
269 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  27.09 
 
 
272 aa  89.4  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  34.46 
 
 
276 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  31.5 
 
 
277 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  31.05 
 
 
276 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  29.17 
 
 
265 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  28.36 
 
 
274 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  28.1 
 
 
283 aa  86.7  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  27.86 
 
 
274 aa  86.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  31.09 
 
 
278 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  26.87 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  31.32 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  34.31 
 
 
323 aa  52.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  27.52 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  34.38 
 
 
287 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  36.96 
 
 
287 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  48.15 
 
 
288 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  45.45 
 
 
288 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  34.38 
 
 
286 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  33.33 
 
 
286 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  45.9 
 
 
285 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  37.29 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  44.07 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  34.38 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  29.49 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  33.73 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  33.73 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  33.73 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  27.86 
 
 
293 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  34.94 
 
 
283 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  26.97 
 
 
336 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  45.65 
 
 
295 aa  42.7  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>