99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2186 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2186  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
70 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0323  heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228429  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 
64 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  41.27 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2837  Heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
939 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
65 aa  47.4  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 
65 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
852 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  40.74 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1150  heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455128  hitchhiker  0.000000264701 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  31.34 
 
 
907 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  35 
 
 
907 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2448  heavy metal-binding protein, putative  36.23 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2074  Heavy metal transport/detoxification protein  36.23 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  44.07 
 
 
790 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
734 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0968  Heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
826 aa  44.3  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  38.24 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
857 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
829 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  47.17 
 
 
871 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  34.33 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  48.48 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  32.81 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  41.67 
 
 
562 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  36.21 
 
 
955 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  33.33 
 
 
561 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2072  copper-translocating P-type ATPase  43.86 
 
 
725 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
839 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  48.39 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 
835 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
976 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
766 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  31.75 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
827 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4550  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 
761 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  43.4 
 
 
867 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  36.51 
 
 
757 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  48.89 
 
 
108 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  32.79 
 
 
68 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  57.58 
 
 
69 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5743  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 
73 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
844 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  41.82 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  37.29 
 
 
1196 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
913 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  31.34 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  50 
 
 
69 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3236  E1-E2 ATPase-associated domain-containing protein  36.92 
 
 
344 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  42.65 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  36.36 
 
 
733 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
887 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 
855 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  47.27 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2465  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
876 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  34.33 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  37.14 
 
 
866 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
726 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0334  heavy metal-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000340547  normal  0.151356 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 
937 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  46.88 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 
793 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  35.38 
 
 
561 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2464  heavy metal translocating P-type ATPase  57.58 
 
 
689 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301674  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  38.24 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  33.33 
 
 
955 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  33.33 
 
 
961 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  33.82 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  35.29 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  28.77 
 
 
802 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  28.77 
 
 
802 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  30.16 
 
 
782 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0968777  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  36.92 
 
 
71 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5305  heavy metal translocating P-type ATPase  30.16 
 
 
782 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.585321  normal  0.36068 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5704  heavy metal translocating P-type ATPase  30.16 
 
 
782 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.563796 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5319  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
744 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1705  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0720999  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  33.9 
 
 
64 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
735 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1212  Heavy metal transport/detoxification protein  30 
 
 
78 aa  40  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4071  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
712 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.515155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  42.22 
 
 
804 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0206  Heavy metal transport/detoxification protein  34.78 
 
 
69 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.855434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>