More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2096 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2096  ABC-3 protein  100 
 
 		 270 aa  514  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3482  zinc ABC transporter, permease protein  55.6 
 
 		 271 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100167  hitchhiker  0.00906276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  30.68 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  31.86 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  27.92 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  27.4 
 
 		 261 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  30 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  26.82 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  26.36 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  26.36 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  26.36 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  26.36 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  26.36 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  26.36 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  31.28 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  26.36 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  26.36 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  26.36 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  26.36 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  25.91 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  25.91 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  29.25 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  25.91 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  23.87 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  28.9 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  30.4 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  27.6 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.05 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  26.89 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  28.86 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  28.86 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  26.89 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  29.17 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  25 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  26.29 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  26.01 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  25.45 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  28.7 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  28.57 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  28.57 
 
 		 274 aa  72  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  30.09 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  28.49 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  27.49 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  29.67 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  30.77 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  23.79 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  26.69 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  28.25 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  29.17 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  29.68 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  27.11 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  27.5 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  29.91 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  28.4 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  25.42 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  25.23 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2253  high-affinity zinc transporter membrane component  31.03 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  29.78 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  30.99 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  27.34 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  27.09 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1149  ABC-3 protein  29.63 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  24.46 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  28.16 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  27.8 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  25.11 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  26.64 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1949  hypothetical protein  33.8 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  25.97 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  26.52 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  25.78 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  27.85 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  26.36 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  25.97 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  25.97 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  23.46 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  32.29 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.234025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  25.97 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  27.09 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  24.82 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  29.41 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  26.21 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  26.24 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2139  cation ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  26.15 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0435  ABC-3 protein  24.85 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.149069  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  31.6 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  26 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  29.05 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  28.43 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  29.05 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  29.05 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  28.8 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  30.63 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0315  hypothetical protein  26.43 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  26.48 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  26.48 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  26.48 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>