298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0144 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3313  thiolase, putative  82.96 
 
 		 535 aa  925    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.795439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0144  thiolase, putative  100 
 
 		 535 aa  1104    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0644  thiolase, putative  74.53 
 
 		 534 aa  812    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4394300000000005e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0630  thiolase, putative  75.28 
 
 		 534 aa  818    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0734  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  78.07 
 
 		 541 aa  848    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000338531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1329  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  70.13 
 
 		 532 aa  788    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000533085  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  34.44 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  32.96 
 
 		 388 aa  172  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.28 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32 
 
 		 395 aa  156  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  29.35 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  30.75 
 
 		 390 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.35 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  30.98 
 
 		 391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.44 
 
 		 387 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.9 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  32.72 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  30 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  30.4 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.54 
 
 		 397 aa  143  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.75 
 
 		 389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.36 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  31.2 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  28.97 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  30.57 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  32.01 
 
 		 387 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  30.93 
 
 		 388 aa  134  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  29.68 
 
 		 387 aa  133  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  29.7 
 
 		 386 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  30.29 
 
 		 386 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.14 
 
 		 376 aa  130  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  28.64 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  28.5 
 
 		 390 aa  126  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  30.14 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  30.92 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  31.18 
 
 		 392 aa  125  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  30.14 
 
 		 392 aa  124  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  30.67 
 
 		 387 aa  124  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  29.86 
 
 		 392 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  28.65 
 
 		 390 aa  120  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.52 
 
 		 392 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.06 
 
 		 387 aa  118  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.49 
 
 		 378 aa  117  6.9999999999999995e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  29.41 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1358  acetyl-CoA C-acyltransferase  27.32 
 
 		 368 aa  115  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  29.23 
 
 		 390 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0795  acetyl-CoA C-acyltransferase  27.39 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0813  acetyl-CoA C-acyltransferase  27.2 
 
 		 368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000183957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  29.75 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.92 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  31.29 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.83 
 
 		 392 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  29.91 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2763  putative SCP-x_thiolase/acetyl- CoA acetyltransferase, PaaJ-like  26.65 
 
 		 400 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470356  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  29.74 
 
 		 388 aa  108  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  28.33 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  29.39 
 
 		 400 aa  105  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1084  acetyl-CoA C-acyltransferase  26.2 
 
 		 368 aa  105  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  30.53 
 
 		 395 aa  104  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  29.51 
 
 		 389 aa  103  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  28.06 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1608  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoAthiolase) (AcaB-1)  25.81 
 
 		 359 aa  100  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.59 
 
 		 388 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  28.38 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  30.12 
 
 		 386 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  29.34 
 
 		 392 aa  98.6  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  29.81 
 
 		 387 aa  97.8  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.77 
 
 		 398 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  27.41 
 
 		 392 aa  95.9  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  30.3 
 
 		 398 aa  95.1  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  29.66 
 
 		 389 aa  94.4  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  31.93 
 
 		 394 aa  94.4  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1242  acetyl-CoA C-acyltransferase  26.94 
 
 		 380 aa  93.6  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0529567  normal  0.0106911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  25.6 
 
 		 407 aa  93.2  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  27.48 
 
 		 389 aa  91.7  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  30.07 
 
 		 397 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  25.63 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  26.21 
 
 		 388 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  28.06 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  26.79 
 
 		 389 aa  87.4  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0270  acetyl-CoA acetyltransferase  25.86 
 
 		 391 aa  87.4  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00178908  normal  0.140204 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  25.71 
 
 		 404 aa  87.4  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0429  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  26.8 
 
 		 386 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413343  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  29.93 
 
 		 388 aa  87  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  28.97 
 
 		 460 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  28.65 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.82 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  25.06 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  28.65 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  27.78 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  29.18 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  29.18 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  29.18 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  27.3 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  24.87 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  26.4 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5352  acetyl-CoA acetyltransferase  26.43 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  0.485306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3981  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.19 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.480226  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  24.74 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  28.99 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>