273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0630 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3313  thiolase, putative  73.72 
 
 		 535 aa  808    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.795439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0144  thiolase, putative  75.28 
 
 		 535 aa  821    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1329  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  64.29 
 
 		 532 aa  729    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000533085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0630  thiolase, putative  100 
 
 		 534 aa  1099    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0644  thiolase, putative  97.19 
 
 		 534 aa  1053    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4394300000000005e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0734  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  73.5 
 
 		 541 aa  815    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000338531  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.98 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  32.54 
 
 		 388 aa  153  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.41 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.82 
 
 		 383 aa  147  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.35 
 
 		 397 aa  144  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.55 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  33.33 
 
 		 387 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  31.34 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  29.87 
 
 		 384 aa  137  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  30.96 
 
 		 392 aa  136  8e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  32.42 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  30.43 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.46 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  31.12 
 
 		 387 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  30.98 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.72 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  29.59 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28 
 
 		 384 aa  131  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  31.18 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.33 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  28.61 
 
 		 396 aa  127  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  28.88 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.53 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  28.9 
 
 		 388 aa  124  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  30.68 
 
 		 387 aa  124  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.42 
 
 		 392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  27.2 
 
 		 395 aa  120  7e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  29.82 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.27 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  28.39 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.85 
 
 		 392 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  29.62 
 
 		 394 aa  118  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  29.85 
 
 		 387 aa  117  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.94 
 
 		 387 aa  117  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  30.14 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  29.86 
 
 		 392 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  32.08 
 
 		 390 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0813  acetyl-CoA C-acyltransferase  26.82 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000183957 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  30.48 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  29.57 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  29.41 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  28.09 
 
 		 388 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  30.14 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  30.26 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  31.13 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  28.49 
 
 		 390 aa  107  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1084  acetyl-CoA C-acyltransferase  25.7 
 
 		 368 aa  106  9e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1358  acetyl-CoA C-acyltransferase  26.92 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  27.09 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  31.08 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0795  acetyl-CoA C-acyltransferase  25.45 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  28.57 
 
 		 390 aa  94.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0429  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  28.46 
 
 		 386 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413343  normal  0.160769 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1608  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoAthiolase) (AcaB-1)  25.42 
 
 		 359 aa  94  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  28.8 
 
 		 389 aa  93.2  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  28.28 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  26.98 
 
 		 386 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2763  putative SCP-x_thiolase/acetyl- CoA acetyltransferase, PaaJ-like  25.81 
 
 		 400 aa  91.3  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470356  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0270  acetyl-CoA acetyltransferase  26.7 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00178908  normal  0.140204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  28.71 
 
 		 392 aa  89.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.81 
 
 		 388 aa  89.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  28.35 
 
 		 400 aa  87.8  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1242  acetyl-CoA C-acyltransferase  26.67 
 
 		 380 aa  87.4  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0529567  normal  0.0106911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  28.43 
 
 		 392 aa  87.8  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  28.97 
 
 		 395 aa  87.4  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  26.92 
 
 		 389 aa  86.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  29.72 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5352  acetyl-CoA acetyltransferase  26.09 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  0.485306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  29.89 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  29.57 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  29.89 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  29.89 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  27.38 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  26.14 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  28.14 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  27.47 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  26.06 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  26.85 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  26.58 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  24.76 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2734  acetyl-CoA acetyltransferase  26.36 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1484  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.19 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  27.59 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2782  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  25.66 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.133795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3870  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  27.45 
 
 		 384 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  28.57 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  23.14 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1647  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  25.16 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1439  acetyl-CoA acetyltransferase  27.86 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  decreased coverage  0.000000285125 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0841  propanoyl-CoA C-acyltransferase  25.21 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000470716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  26.2 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1546  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.91 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  27.71 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  26.73 
 
 		 386 aa  73.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>