252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0734 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3313  thiolase, putative  76.23 
 
 
535 aa  847    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.795439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0644  thiolase, putative  72.93 
 
 
534 aa  821    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4394300000000005e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0144  thiolase, putative  78.07 
 
 
535 aa  859    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0630  thiolase, putative  73.5 
 
 
534 aa  822    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0734  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  100 
 
 
541 aa  1114    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000338531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1329  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  70.86 
 
 
532 aa  807    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000533085  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 
388 aa  160  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  33.02 
 
 
388 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.59 
 
 
383 aa  154  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.66 
 
 
395 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  33.42 
 
 
387 aa  146  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.33 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.77 
 
 
397 aa  140  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  29.58 
 
 
384 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  31.4 
 
 
387 aa  137  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.24 
 
 
389 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.64 
 
 
376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.03 
 
 
387 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.78 
 
 
384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.05 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  32.34 
 
 
394 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  31.39 
 
 
391 aa  131  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.78 
 
 
378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  29.4 
 
 
388 aa  130  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  29.29 
 
 
388 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  31.01 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  29.89 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  33.63 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  32.01 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  31.62 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.33 
 
 
392 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  28.49 
 
 
386 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  30.13 
 
 
386 aa  128  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  30.23 
 
 
392 aa  127  7e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.42 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.72 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.42 
 
 
392 aa  121  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  28.84 
 
 
395 aa  120  7e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  29.15 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  28.68 
 
 
390 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  30.26 
 
 
394 aa  118  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  28.92 
 
 
390 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  29.44 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  31.71 
 
 
386 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  29.63 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  28.4 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  28.67 
 
 
388 aa  112  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  28.8 
 
 
388 aa  110  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  29.06 
 
 
392 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  32.08 
 
 
390 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  29.63 
 
 
392 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1084  acetyl-CoA C-acyltransferase  27.02 
 
 
368 aa  107  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0813  acetyl-CoA C-acyltransferase  27.53 
 
 
368 aa  106  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000183957 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0795  acetyl-CoA C-acyltransferase  26.7 
 
 
369 aa  105  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  28.7 
 
 
392 aa  102  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1358  acetyl-CoA C-acyltransferase  26.23 
 
 
368 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1242  acetyl-CoA C-acyltransferase  28.06 
 
 
380 aa  101  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0529567  normal  0.0106911 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  29.78 
 
 
390 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  29.91 
 
 
388 aa  99.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  29.27 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  28.57 
 
 
387 aa  97.8  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2763  putative SCP-x_thiolase/acetyl- CoA acetyltransferase, PaaJ-like  26.72 
 
 
400 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470356  normal  0.471158 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1608  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoAthiolase) (AcaB-1)  26.19 
 
 
359 aa  95.1  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  29.45 
 
 
392 aa  93.6  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  28.57 
 
 
389 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  29.32 
 
 
395 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  30.27 
 
 
394 aa  89  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  26.2 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  28.75 
 
 
388 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  27.3 
 
 
389 aa  87.8  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  30.24 
 
 
397 aa  87  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  26.18 
 
 
404 aa  86.7  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  30.15 
 
 
388 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  30.15 
 
 
394 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  25.9 
 
 
407 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  28.4 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  28.95 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  30.55 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.26 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  29.63 
 
 
395 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  29.63 
 
 
395 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  29.63 
 
 
409 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  26.97 
 
 
401 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  28.61 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  27.62 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  27.27 
 
 
389 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  26.63 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.55 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  26.28 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  27.59 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  25.55 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1439  acetyl-CoA acetyltransferase  28.18 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  decreased coverage  0.000000285125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0429  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  25.78 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413343  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2734  acetyl-CoA acetyltransferase  27.86 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  26.84 
 
 
392 aa  77  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1647  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  26.82 
 
 
360 aa  76.6  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  28.83 
 
 
388 aa  76.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  27.44 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  25.51 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  25 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>