More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3313 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3313  thiolase, putative  100 
 
 		 535 aa  1099    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.795439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0644  thiolase, putative  72.59 
 
 		 534 aa  779    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4394300000000005e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1329  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  70.7 
 
 		 532 aa  787    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000533085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0144  thiolase, putative  82.96 
 
 		 535 aa  908    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0734  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  76.23 
 
 		 541 aa  823    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000338531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0630  thiolase, putative  73.72 
 
 		 534 aa  790    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  36.12 
 
 		 388 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  35.84 
 
 		 388 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.83 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  30.85 
 
 		 384 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  33.8 
 
 		 387 aa  150  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  32.19 
 
 		 396 aa  150  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.85 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  30.75 
 
 		 390 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.26 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.66 
 
 		 395 aa  148  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.9 
 
 		 387 aa  147  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  31.23 
 
 		 391 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  30.33 
 
 		 392 aa  145  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  31.03 
 
 		 388 aa  145  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  30.98 
 
 		 387 aa  144  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  32.87 
 
 		 387 aa  143  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.56 
 
 		 397 aa  143  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.19 
 
 		 389 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.35 
 
 		 384 aa  141  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  29.81 
 
 		 386 aa  140  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  32.08 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.68 
 
 		 386 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  30.16 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  31.33 
 
 		 386 aa  136  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  29.97 
 
 		 390 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  32.53 
 
 		 394 aa  134  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.31 
 
 		 390 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  30.27 
 
 		 392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.34 
 
 		 392 aa  130  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  31.83 
 
 		 387 aa  130  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  32.3 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.44 
 
 		 387 aa  127  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  31.75 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.65 
 
 		 378 aa  127  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  31.45 
 
 		 392 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  29.73 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  30.52 
 
 		 388 aa  124  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  32.36 
 
 		 388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0813  acetyl-CoA C-acyltransferase  28.5 
 
 		 368 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000183957 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.25 
 
 		 392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.04 
 
 		 392 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  33.11 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  32.21 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  30.27 
 
 		 394 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1084  acetyl-CoA C-acyltransferase  27.27 
 
 		 368 aa  117  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0795  acetyl-CoA C-acyltransferase  27.71 
 
 		 369 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  29.83 
 
 		 387 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  30.38 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1358  acetyl-CoA C-acyltransferase  26.99 
 
 		 368 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2763  putative SCP-x_thiolase/acetyl- CoA acetyltransferase, PaaJ-like  27.8 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470356  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  30.75 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1242  acetyl-CoA C-acyltransferase  28.04 
 
 		 380 aa  105  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0529567  normal  0.0106911 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.32 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  28 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  31.45 
 
 		 395 aa  100  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  27.42 
 
 		 386 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  30.02 
 
 		 386 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  31.52 
 
 		 392 aa  97.8  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  26.49 
 
 		 407 aa  97.8  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 394 aa  97.4  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1608  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoAthiolase) (AcaB-1)  24.73 
 
 		 359 aa  96.3  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0429  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  28.3 
 
 		 386 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413343  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  33.1 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  32.13 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  28.57 
 
 		 398 aa  94.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  28.12 
 
 		 390 aa  94  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  29.94 
 
 		 388 aa  94  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  26.06 
 
 		 404 aa  93.2  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.11 
 
 		 398 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  28.44 
 
 		 389 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0270  acetyl-CoA acetyltransferase  29.7 
 
 		 391 aa  91.3  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00178908  normal  0.140204 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  27.64 
 
 		 389 aa  90.1  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  27.66 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  28.24 
 
 		 389 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2782  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.41 
 
 		 392 aa  89.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.133795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  29.64 
 
 		 394 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  27.64 
 
 		 389 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.25 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  26.14 
 
 		 392 aa  87.8  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3981  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.83 
 
 		 385 aa  87.4  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.480226  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  28.17 
 
 		 394 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  28.31 
 
 		 388 aa  86.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  28.31 
 
 		 394 aa  86.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  28.88 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.25 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  25.86 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3886  thiolase  29.24 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5352  acetyl-CoA acetyltransferase  25.21 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  0.485306 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  25.06 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  27.06 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  28.92 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  26.42 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  29.05 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>