90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3836 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 		 238 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  90.34 
 
 		 237 aa  363  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  48.24 
 
 		 269 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  38.58 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  39.11 
 
 		 293 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3428  flagellar assembly protein fliH, putative  33.98 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  35.67 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  26.51 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  30.91 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  28.4 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  28.12 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  28.16 
 
 		 324 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  33.33 
 
 		 267 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  24.69 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  27.49 
 
 		 403 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  31.12 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  32.31 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  29.07 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  27.46 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  30.64 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1650  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  29.34 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  26.99 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  29.79 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  31.13 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  29.1 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  27.38 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  25.95 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  32.14 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1392  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  30.7 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0445381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  28.95 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  27.47 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1595  flagellar assembly protein FliH, putative  36.52 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2005  flagellar assembly protein H  33.33 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3097  flagellar assembly protein FliH  29.01 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  32.5 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  27.59 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  27.45 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  26.49 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  27.11 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  27.11 
 
 		 338 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  27.11 
 
 		 338 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  27.49 
 
 		 316 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  27.11 
 
 		 338 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  27.11 
 
 		 320 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  25.95 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  24.7 
 
 		 318 aa  52.4  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  25.61 
 
 		 316 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  22.09 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  25.61 
 
 		 316 aa  52  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  26.09 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  27.43 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1691  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  21.85 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  23.84 
 
 		 375 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2465  flagellar assembly protein FliH  28.07 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000780406  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  24.84 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  26.97 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  30.25 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  28.57 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  26.71 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  21.43 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  21.92 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  26.25 
 
 		 300 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  26.58 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  25.58 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.32 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  29.38 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  31.07 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  28.5 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2561  flagellar assembly protein FliH  28.07 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00219056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  26.58 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  28.82 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  24.85 
 
 		 251 aa  45.4  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  26.04 
 
 		 349 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  21.52 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2356  flagellar assembly protein FliH  34.78 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.576536  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  23.46 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.09 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  29.25 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  23.84 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  27.98 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1570  hypothetical protein  25.77 
 
 		 640 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.168209  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  27.98 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  29.34 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  22 
 
 		 266 aa  42.4  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  26.94 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  26.94 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  26.94 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  27.81 
 
 		 226 aa  42.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2217  flagellar assembly protein FliH, putative  35.29 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174846  hitchhiker  0.00568244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>