144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5263 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  100 
 
 		 278 aa  558  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  71.61 
 
 		 255 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  47.25 
 
 		 207 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  42.28 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  49.45 
 
 		 226 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  49.45 
 
 		 226 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  49.45 
 
 		 226 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  49.45 
 
 		 226 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  49.45 
 
 		 226 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  49.45 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  48.9 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  42.04 
 
 		 227 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  41.63 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  44.44 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  49.7 
 
 		 227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  49.46 
 
 		 227 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  49.1 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  48.91 
 
 		 225 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  48.91 
 
 		 227 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2452  flagellar assembly protein H  49.46 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0964661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3066  flagellar assembly protein H  49.46 
 
 		 227 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00102567  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  39.89 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  32.9 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  38.12 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  40.96 
 
 		 252 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  38.82 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  37.16 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  35.14 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  37.78 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  37.78 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  37.78 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  40 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  37.78 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  40 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  40 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  39.41 
 
 		 228 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  39.41 
 
 		 228 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  30.4 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  38.29 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  36.02 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  33.33 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  32.6 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  36.57 
 
 		 245 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  36.57 
 
 		 245 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  34.48 
 
 		 238 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  34.48 
 
 		 238 aa  105  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  34.48 
 
 		 238 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  29.86 
 
 		 227 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  33.04 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  36.05 
 
 		 201 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  36.53 
 
 		 241 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  31.4 
 
 		 339 aa  96.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  33.33 
 
 		 234 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  35.48 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  33.68 
 
 		 303 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  37.2 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  31.25 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  31.43 
 
 		 316 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  31.74 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  28.37 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  29.27 
 
 		 338 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  29.27 
 
 		 338 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  30 
 
 		 316 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  30.99 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  29.27 
 
 		 338 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  28.78 
 
 		 338 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  30.26 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  28.44 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  29.01 
 
 		 334 aa  87  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  32.91 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  31.79 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  31.79 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  31.94 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  30.88 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  27.78 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  29.28 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  26.88 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  26.95 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  33.19 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  29.17 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  26.56 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  26.75 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  30.73 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  32.43 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  25.93 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  27.17 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  27.41 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  24.86 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  27.17 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  24.86 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  23.28 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  24.86 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  25.99 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  24.21 
 
 		 236 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  23.76 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  24.31 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  23.81 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  29.27 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  23.35 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  30.65 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>