158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1538 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  100 
 
 
268 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  65.3 
 
 
272 aa  345  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  65.78 
 
 
272 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  62.36 
 
 
264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  63.41 
 
 
254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  62.35 
 
 
260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  60.31 
 
 
263 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  60.78 
 
 
267 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  59.22 
 
 
268 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  56.76 
 
 
266 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  36.03 
 
 
296 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  40 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  29.27 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  36.99 
 
 
242 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  29.83 
 
 
349 aa  96.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  28.98 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  28.87 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  31.2 
 
 
339 aa  89.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  30.58 
 
 
300 aa  89  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  33.5 
 
 
233 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  29.58 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  30.86 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  28.05 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  29.95 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  29.9 
 
 
266 aa  79  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  30.97 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  30.72 
 
 
235 aa  77  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  27.88 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  28.86 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  25.53 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  29.65 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  23.46 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  25.53 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  28.48 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  23.46 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  27.51 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  27.03 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 
224 aa  72  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  28.92 
 
 
236 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  25 
 
 
334 aa  72  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  28.48 
 
 
236 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  29.22 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  26.39 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  27.71 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  24.31 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  27.23 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  27.12 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  27.12 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  27.12 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  27.65 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  23.46 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  27.8 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  26.75 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  26.75 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  28.25 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  27.72 
 
 
320 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  27.85 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  26.96 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  28.33 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  25.84 
 
 
209 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  27.96 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  27.7 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  26.03 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  25.27 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3563  flagellar assembly protein FliH  21.95 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  27.49 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  25.44 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  25.23 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  25.12 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  26.15 
 
 
241 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  23.35 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  26.89 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  26.95 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  26.89 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  28.09 
 
 
251 aa  62.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  27.22 
 
 
228 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  26.85 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  26.85 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  26.85 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  27.68 
 
 
207 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  30.86 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  26.85 
 
 
228 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  28.16 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  29.48 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  24.88 
 
 
303 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  29.88 
 
 
293 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  25.87 
 
 
228 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  28.36 
 
 
280 aa  58.9  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  26.64 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  27.93 
 
 
308 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  25.64 
 
 
375 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  25.91 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  25.91 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  25.91 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  26.23 
 
 
242 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0220  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  28.74 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  30.77 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  27.45 
 
 
235 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  27.85 
 
 
236 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  26.26 
 
 
235 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>