65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_B0063 on replicon NC_010157
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42250  type III secretion system protein  58 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  51.67 
 
 		 212 aa  218  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  51.71 
 
 		 211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  32 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  30.39 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3746  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  30.77 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212499  hitchhiker  0.00667574 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4223  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  28.43 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4745  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  28.43 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.528631 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4848  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  28.28 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3518  Type III secretion system HrpE/YscL  28.28 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253777  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5436  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  28.28 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0949322  normal  0.0915809 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  29.89 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  25 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  30.19 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1691  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  24.87 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0705  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.11 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2005  flagellar assembly protein H  31.25 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.26 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  26.23 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  26.76 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.34 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0423  type III secretion system protein HrpB  25.67 
 
 		 289 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00673327  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1991  type III secretion system protein HrpB  25.67 
 
 		 277 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.51 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1899  type III secretion system protein HrpB  25.67 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  28.74 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  27.43 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2715  hypothetical protein  24.12 
 
 		 290 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3124  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein like  32.79 
 
 		 318 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0778311  hitchhiker  0.00270751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  27.71 
 
 		 307 aa  52  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2289  flagellar assembly protein FliH, putative  22.94 
 
 		 254 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  24.86 
 
 		 255 aa  51.6  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  32.1 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  35.63 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  22.83 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5938  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  25.84 
 
 		 289 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  29.66 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  30.25 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1335  flagellar assembly protein FliH  30.68 
 
 		 286 aa  49.7  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2217  flagellar assembly protein FliH, putative  41.18 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174846  hitchhiker  0.00568244 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  24.35 
 
 		 262 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0869  type III secretion system protein HrpB  26.04 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371286  decreased coverage  0.00150472 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  28.41 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  23.08 
 
 		 304 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  26.54 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  31.34 
 
 		 268 aa  45.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3031  flagellar assembly protein FliH  27.17 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.715642  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  28.25 
 
 		 231 aa  45.1  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3428  flagellar assembly protein fliH, putative  25.64 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  22.69 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  27.35 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  28.35 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5214  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.3 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  35.14 
 
 		 247 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  27.32 
 
 		 244 aa  42.4  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5635  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  26.96 
 
 		 335 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0813541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  25.21 
 
 		 261 aa  42  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1593  flagellar assembly protein H  30.43 
 
 		 290 aa  42  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  29.17 
 
 		 293 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03397  type III secretion system protein HrpB  23.63 
 
 		 233 aa  41.6  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  33.85 
 
 		 242 aa  41.6  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  27.32 
 
 		 244 aa  41.6  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  29.65 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1570  hypothetical protein  29.85 
 
 		 640 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.168209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>