150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1018 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 		 261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  44.22 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  32.51 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  32.1 
 
 		 244 aa  112  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  31.88 
 
 		 231 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  35.59 
 
 		 303 aa  95.5  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  35.98 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  37.2 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  31.32 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  32.02 
 
 		 248 aa  89  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  31.52 
 
 		 209 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  34.16 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  28.51 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  27.62 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  29.96 
 
 		 225 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  36.02 
 
 		 227 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  36.02 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  33.14 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  36.02 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  36.02 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  29.63 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  34.16 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  35.4 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  30.86 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  31.82 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  29.49 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  29.69 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  30.63 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  26.81 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  31.25 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  31.25 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  31.25 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  31.25 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  31.25 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  30.91 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  30.91 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  31.9 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  30.11 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  33.76 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  31.85 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  29.45 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  29.68 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  29.68 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  29.68 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  29.81 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  32.79 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  31.41 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0474  flagellar assembly protein H  28.3 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  35.03 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  34.39 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  34.39 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  31.17 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  34.39 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  28.88 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  27.62 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  34.39 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2452  flagellar assembly protein H  36.65 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0964661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3066  flagellar assembly protein H  36.65 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00102567  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  34.46 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  34.46 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  28.28 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  34.46 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  34.19 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  34.46 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  30.18 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  27.12 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  26.56 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  29.49 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  30.49 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  26.97 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  30.77 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  29.71 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  31.11 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  24.57 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  27.78 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  29.14 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  30.81 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.97 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  30 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  27.49 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  30.34 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  30.29 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  31.82 
 
 		 224 aa  62  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  29.14 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  25.13 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  28.65 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  26.64 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  29.22 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  25.73 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  30.34 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  28.44 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2289  flagellar assembly protein FliH, putative  32.02 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  31.76 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0220  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  27.75 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  24.24 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  24.24 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2670  flagellar assembly protein FliH, putative  32.04 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  29.59 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  24.22 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  24.84 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>