34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0705 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0705  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  100 
 
 
236 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0759  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  36.14 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1270  hypothetical protein  34.89 
 
 
229 aa  88.6  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.96305  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  27.23 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1375  hypothetical protein  29.38 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.917362  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  26.11 
 
 
210 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  29.1 
 
 
308 aa  55.8  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  23.53 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  28 
 
 
224 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3097  flagellar assembly protein FliH  26.67 
 
 
255 aa  52  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0351  flagellar assembly protein FliH, putative  22.63 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1335  flagellar assembly protein FliH  25.93 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2670  flagellar assembly protein FliH, putative  24.49 
 
 
250 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1392  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  31.68 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0445381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42250  type III secretion system protein  28.19 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399821  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  25.52 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  29.11 
 
 
268 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  24.61 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  25.38 
 
 
295 aa  45.8  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  33.98 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  29.11 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  28.48 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  24.71 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  24.17 
 
 
261 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2561  flagellar assembly protein FliH  32.98 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00219056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3031  flagellar assembly protein FliH  25.34 
 
 
232 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.715642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2465  flagellar assembly protein FliH  28.71 
 
 
208 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000780406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  24.43 
 
 
231 aa  42.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  39.29 
 
 
164 aa  42  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  44.44 
 
 
306 aa  42  0.008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2289  flagellar assembly protein FliH, putative  21.11 
 
 
254 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  39.29 
 
 
164 aa  42  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  25.93 
 
 
242 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  24 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>