54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2005 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2005  flagellar assembly protein H  100 
 
 
256 aa  508  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  50.39 
 
 
262 aa  264  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.11 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  25.44 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  26.21 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3097  flagellar assembly protein FliH  27.27 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  26.18 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1691  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  30.77 
 
 
241 aa  72  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  32.32 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  31.71 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  30.51 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  26.63 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.17 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  23.44 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  21.67 
 
 
280 aa  62.8  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  29.17 
 
 
269 aa  62.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  28.64 
 
 
210 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  23.56 
 
 
238 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  33.33 
 
 
238 aa  58.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  21.18 
 
 
308 aa  56.6  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2715  hypothetical protein  20 
 
 
290 aa  55.8  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.97 
 
 
242 aa  55.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  32.17 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  26.04 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  22.55 
 
 
249 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  29.41 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3746  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  31.02 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212499  hitchhiker  0.00667574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  22.06 
 
 
304 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  23.93 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4148  flagellar assembly protein FliH  30.51 
 
 
289 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4223  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  28.35 
 
 
209 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338425  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2171  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  23.98 
 
 
251 aa  48.9  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4848  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  29.23 
 
 
209 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130597  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5436  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  29.23 
 
 
209 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0949322  normal  0.0915809 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  27.43 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3518  Type III secretion system HrpE/YscL  29.23 
 
 
209 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42250  type III secretion system protein  30.48 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399821  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4745  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  27.69 
 
 
209 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.528631 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.56 
 
 
224 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  26.25 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  26.25 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  26.51 
 
 
226 aa  45.8  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0843  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  28.19 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  27.87 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  28.99 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  27.14 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1335  flagellar assembly protein FliH  24.43 
 
 
286 aa  43.5  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  29.94 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.49 
 
 
233 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1392  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  30.95 
 
 
211 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0445381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  23.68 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  27.54 
 
 
227 aa  42.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1650  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  23.7 
 
 
218 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512171  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2465  flagellar assembly protein FliH  31.75 
 
 
208 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000780406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>