47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42250 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_42250  type III secretion system protein  100 
 
 		 214 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  58 
 
 		 210 aa  238  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  53.73 
 
 		 212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  52.74 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  40 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  37 
 
 		 205 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  28.85 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4745  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  27.22 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.528631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4223  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  27.22 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3746  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  28.33 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212499  hitchhiker  0.00667574 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5436  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  26.67 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0949322  normal  0.0915809 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3518  Type III secretion system HrpE/YscL  26.67 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253777  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4848  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  26.67 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  31.16 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  27.66 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  26.4 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2715  hypothetical protein  26.74 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0423  type III secretion system protein HrpB  27.6 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00673327  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  37.62 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1991  type III secretion system protein HrpB  27.6 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1899  type III secretion system protein HrpB  27.6 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  30.48 
 
 		 306 aa  54.7  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  33.71 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1691  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  33.86 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  26.29 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  32.95 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  29.57 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5635  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  33.33 
 
 		 335 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0813541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2005  flagellar assembly protein H  30.48 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1335  flagellar assembly protein FliH  31.69 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0705  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  28.19 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  23.08 
 
 		 300 aa  46.6  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5852  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  32.46 
 
 		 335 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  31.61 
 
 		 307 aa  46.2  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  29.41 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0745  type III secretion system protein HrpB  31.68 
 
 		 238 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.6 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  27.88 
 
 		 241 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  27.49 
 
 		 238 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  31.25 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  22.99 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2217  flagellar assembly protein FliH, putative  39.71 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174846  hitchhiker  0.00568244 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5938  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  26.87 
 
 		 289 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1650  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  28.1 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3124  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein like  29.41 
 
 		 318 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0778311  hitchhiker  0.00270751 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  27.81 
 
 		 262 aa  42  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>