108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1217 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  100 
 
 
308 aa  612  9.999999999999999e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  39 
 
 
300 aa  206  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  31.21 
 
 
306 aa  130  3e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  29.59 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  27.44 
 
 
304 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  25.49 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  23.86 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  26.84 
 
 
258 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  25.82 
 
 
262 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  29.89 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1691  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  22.37 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  29.56 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  27.45 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  26.22 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.59 
 
 
280 aa  67  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  27.42 
 
 
211 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.67 
 
 
231 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  26.2 
 
 
212 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  25.14 
 
 
235 aa  63.9  0.000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  23.24 
 
 
238 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.64 
 
 
262 aa  63.2  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  21.43 
 
 
249 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  31.82 
 
 
205 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  26.51 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  26.56 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1335  flagellar assembly protein FliH  24.27 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3428  flagellar assembly protein fliH, putative  27.5 
 
 
250 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2715  hypothetical protein  22.61 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  26.75 
 
 
252 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42250  type III secretion system protein  26.4 
 
 
214 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399821  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  25.95 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  27.93 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4148  flagellar assembly protein FliH  24.39 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  27.78 
 
 
268 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  27.11 
 
 
324 aa  56.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  30.92 
 
 
205 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2005  flagellar assembly protein H  22.01 
 
 
256 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  21.4 
 
 
262 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0705  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  29.1 
 
 
236 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  23.9 
 
 
334 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  26.97 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  24.42 
 
 
252 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  21.34 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  21.34 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  25 
 
 
263 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  25.47 
 
 
257 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.61 
 
 
224 aa  52.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  26.4 
 
 
267 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  23.17 
 
 
248 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  24.16 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2670  flagellar assembly protein FliH, putative  19.59 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  21.46 
 
 
255 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  25.77 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  27.1 
 
 
242 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  25.44 
 
 
264 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2171  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  20.4 
 
 
251 aa  49.3  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  20.73 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  26.04 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  24.37 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  22.28 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  22.42 
 
 
209 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  23.57 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  22.87 
 
 
227 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1392  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  25.51 
 
 
211 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0445381  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3518  Type III secretion system HrpE/YscL  21.51 
 
 
209 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253777  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  23.44 
 
 
227 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4848  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  21.51 
 
 
209 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130597  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5436  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  21.51 
 
 
209 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0949322  normal  0.0915809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  22.22 
 
 
233 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  20.81 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  20 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2217  flagellar assembly protein FliH, putative  33.82 
 
 
201 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174846  hitchhiker  0.00568244 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1570  hypothetical protein  23.83 
 
 
640 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.168209  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  19.23 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1636  type III secretion system protein HrpB  24.1 
 
 
238 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  23.93 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0685  type III secretion system protein HrpB  24.1 
 
 
238 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1595  flagellar assembly protein FliH, putative  26.45 
 
 
200 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2287  type III secretion system protein HrpB  24.1 
 
 
238 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0183918  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2204  type III secretion system protein HrpB  24.1 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0628  type III secretion system protein HrpB  24.1 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  22.92 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  23.64 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5938  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  24.2 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2561  flagellar assembly protein FliH  27.55 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00219056  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  19.14 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  22.34 
 
 
227 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0351  flagellar assembly protein FliH, putative  23.89 
 
 
246 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0745  type III secretion system protein HrpB  23.38 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  21.69 
 
 
207 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4223  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  23.12 
 
 
209 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338425  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1949  type III secretion system protein HrpB  24.1 
 
 
215 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  21.47 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4745  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  23.12 
 
 
209 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.528631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  21.88 
 
 
231 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  19.31 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  23.12 
 
 
272 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  23.66 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  22.34 
 
 
227 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2465  flagellar assembly protein FliH  32 
 
 
208 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000780406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>