105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3302 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 
257 aa  513  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3428  flagellar assembly protein fliH, putative  45.78 
 
 
250 aa  204  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  37.4 
 
 
304 aa  152  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  39.84 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  31.25 
 
 
269 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  37.5 
 
 
237 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  37.35 
 
 
238 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  31.37 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  33.53 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  30.72 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  28.57 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  31.33 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  26.88 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  28.93 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  26.79 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  31.41 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  29.81 
 
 
316 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  31.29 
 
 
318 aa  63.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  31.31 
 
 
244 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  29.19 
 
 
316 aa  62  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  30.13 
 
 
316 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  31.31 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  28.66 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  29.17 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  32.35 
 
 
224 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1650  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  29.57 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512171  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1691  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  23.53 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  31.61 
 
 
338 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.54 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  31.61 
 
 
338 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  31.61 
 
 
338 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  27.54 
 
 
255 aa  59.3  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  31.61 
 
 
338 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  37.96 
 
 
233 aa  58.5  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  22.99 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0843  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  34.55 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  26.45 
 
 
316 aa  55.8  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  31.37 
 
 
205 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  25.83 
 
 
306 aa  55.8  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  24.61 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  24.5 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2273  flagellar assembly protein FliH  27.2 
 
 
296 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.362027  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2171  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  25.67 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  29.19 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  24.28 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  29.09 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2005  flagellar assembly protein H  26.04 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  25.73 
 
 
258 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  29.53 
 
 
205 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1595  flagellar assembly protein FliH, putative  34.19 
 
 
200 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  31.08 
 
 
242 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  27.27 
 
 
339 aa  52.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  35.85 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  27.85 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3097  flagellar assembly protein FliH  30.19 
 
 
255 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  30.91 
 
 
245 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  30.08 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  26.58 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  30.18 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  26.87 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2561  flagellar assembly protein FliH  28.23 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00219056  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1392  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  30.16 
 
 
211 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0445381  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1335  flagellar assembly protein FliH  27.21 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  34.02 
 
 
227 aa  49.7  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  24.86 
 
 
231 aa  49.3  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  22.84 
 
 
238 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  24.73 
 
 
212 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  28.48 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0976  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  31.11 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2465  flagellar assembly protein FliH  26.61 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000780406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  33.33 
 
 
201 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  24.66 
 
 
375 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  27.93 
 
 
403 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1652  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  32.64 
 
 
259 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257969  normal  0.368301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  25.93 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  23.77 
 
 
228 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  27.44 
 
 
210 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  23.77 
 
 
228 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  23.77 
 
 
228 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  31.36 
 
 
296 aa  46.2  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  28.03 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1593  flagellar assembly protein H  26.58 
 
 
290 aa  45.4  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  26.43 
 
 
228 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0351  flagellar assembly protein FliH, putative  24.05 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0705  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  33.98 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  24.84 
 
 
245 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  24.84 
 
 
245 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  27.19 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  28.07 
 
 
226 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  28.07 
 
 
226 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  28.07 
 
 
226 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  28.07 
 
 
226 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  28.07 
 
 
226 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  28.07 
 
 
226 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  28.07 
 
 
226 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  29.09 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  30.43 
 
 
267 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  25.99 
 
 
228 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  26.71 
 
 
211 aa  42.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2268  flagellar assembly protein FliH  32.48 
 
 
200 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>