96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0850 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  33.62 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  27.68 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  31.87 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  33.02 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  23.68 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42250  type III secretion system protein  28.85 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  26.8 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  25 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.24 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  23.72 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  24.88 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  26.04 
 
 		 304 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1691  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  23.08 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2005  flagellar assembly protein H  23.56 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  23.81 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  25.14 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  22.77 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  25.99 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1595  flagellar assembly protein FliH, putative  30.19 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  25.32 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.22 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  28.57 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  24.12 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  27.17 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  31.79 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  23.35 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  28.74 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  31.49 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  21.74 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  31.49 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  24.37 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  31.49 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  27.03 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  29.41 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  22.99 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0351  flagellar assembly protein FliH, putative  23.81 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  27.93 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  29.95 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2670  flagellar assembly protein FliH, putative  24.86 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  29.5 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  24.86 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  28 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  26.78 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  26.9 
 
 		 316 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  26.12 
 
 		 295 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  27.17 
 
 		 318 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  26.9 
 
 		 316 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  26.43 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  25.86 
 
 		 320 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1335  flagellar assembly protein FliH  21.74 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  25.66 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2268  flagellar assembly protein FliH  24.12 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  27.62 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  23.78 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  25.81 
 
 		 334 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  21.92 
 
 		 238 aa  48.9  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  25.38 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  24.68 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2217  flagellar assembly protein FliH, putative  29 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174846  hitchhiker  0.00568244 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  20.89 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  23.6 
 
 		 324 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2356  flagellar assembly protein FliH  28.3 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.576536  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  25.29 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  24.29 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1991  type III secretion system protein HrpB  20.21 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1899  type III secretion system protein HrpB  20.21 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0423  type III secretion system protein HrpB  20.21 
 
 		 289 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00673327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  25.77 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  26.51 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  26.9 
 
 		 338 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  23.61 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  26.26 
 
 		 338 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  23.49 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  23.19 
 
 		 244 aa  45.4  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1392  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  22.5 
 
 		 211 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0445381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  28.14 
 
 		 227 aa  45.1  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2715  hypothetical protein  22.97 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  26.9 
 
 		 338 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  25.25 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2273  flagellar assembly protein FliH  25 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.362027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  23.19 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  23.39 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  27.43 
 
 		 339 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2465  flagellar assembly protein FliH  19.82 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000780406  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5938  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  24.16 
 
 		 289 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2561  flagellar assembly protein FliH  19.82 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00219056  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4848  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  23.25 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  23.98 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3518  Type III secretion system HrpE/YscL  23.25 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253777  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5436  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  23.25 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0949322  normal  0.0915809 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0759  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  29.91 
 
 		 233 aa  42  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  25.83 
 
 		 316 aa  42  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3428  flagellar assembly protein fliH, putative  21.09 
 
 		 250 aa  41.6  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>