161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1160 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  100 
 
 		 233 aa  454  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  37.56 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  32.28 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  34.55 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  35.8 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  31.75 
 
 		 264 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  31.75 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  33.18 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  32.28 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  32.14 
 
 		 334 aa  98.6  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  35.39 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  37.3 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  30.41 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  33.52 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  34.41 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  34.02 
 
 		 320 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  32.28 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  33.33 
 
 		 316 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  30.94 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  35.29 
 
 		 307 aa  92.4  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  32.31 
 
 		 403 aa  92  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  33.5 
 
 		 272 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  32.99 
 
 		 316 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  33.33 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  32.99 
 
 		 316 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  32.99 
 
 		 316 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  32.28 
 
 		 300 aa  89.7  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  32.47 
 
 		 338 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  31.91 
 
 		 324 aa  89  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  31.96 
 
 		 338 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  32.49 
 
 		 272 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  31.96 
 
 		 338 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  32.8 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  31.96 
 
 		 338 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  31.91 
 
 		 339 aa  86.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  30.93 
 
 		 318 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  32.76 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  29.55 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  32.42 
 
 		 206 aa  85.5  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  32.42 
 
 		 206 aa  85.5  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  35.8 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  28.07 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  36.36 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  28.04 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  28.07 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  29.89 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  29.65 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  34.94 
 
 		 375 aa  79  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  29.66 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  27.22 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  29.1 
 
 		 349 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  29.31 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  29.31 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  24.71 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  28.8 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  32.73 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  34.22 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  33.72 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  25 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  26.06 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  27.53 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  25 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  26.97 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  32.95 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  27.78 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  29.63 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  29.44 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  24.71 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  30.91 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  27.71 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  29.95 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  27.51 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  32.4 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  26.38 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  24.73 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  30.39 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  27.01 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  27.01 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  25.97 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  32.79 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  33.33 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  27.91 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.37 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  37.96 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  27.93 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  28.42 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  25.9 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  25.3 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  24.69 
 
 		 262 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  33.96 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  30.43 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  23.96 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  28.18 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  30.43 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0843  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  31.72 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  27.71 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  30.06 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  25.41 
 
 		 293 aa  52  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  25.86 
 
 		 241 aa  52  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  22.09 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>