66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3097 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3097  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 
255 aa  519  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2005  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  25.84 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  28.91 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  28.38 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  24.54 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.69 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  23.83 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  28.78 
 
 
307 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  25.49 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2670  flagellar assembly protein FliH, putative  29.22 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  31.03 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  27.08 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  27.59 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  26.87 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2561  flagellar assembly protein FliH  32.31 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00219056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  21.36 
 
 
258 aa  55.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  23.81 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1392  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  30.16 
 
 
211 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0445381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2465  flagellar assembly protein FliH  31.54 
 
 
208 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000780406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1595  flagellar assembly protein FliH, putative  35.4 
 
 
200 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  30.19 
 
 
257 aa  52  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  25.88 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  22.05 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  24.9 
 
 
300 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0705  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.67 
 
 
236 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  28.12 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2289  flagellar assembly protein FliH, putative  25.48 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1335  flagellar assembly protein FliH  22.66 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2268  flagellar assembly protein FliH  31.53 
 
 
200 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  24.65 
 
 
262 aa  48.9  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  35.64 
 
 
245 aa  48.9  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  24.16 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2171  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  22.55 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  23.6 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  25.39 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  23.6 
 
 
264 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.23 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  27.17 
 
 
295 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.6 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0843  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  25.4 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  26.92 
 
 
209 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  33.33 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2217  flagellar assembly protein FliH, putative  35.21 
 
 
201 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174846  hitchhiker  0.00568244 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  22.93 
 
 
334 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  32.41 
 
 
245 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  32.41 
 
 
245 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  28.45 
 
 
245 aa  45.4  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  22.56 
 
 
260 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4148  flagellar assembly protein FliH  24.64 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  32.41 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0271  hypothetical protein  26.67 
 
 
524 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  26.92 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  25.14 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2356  flagellar assembly protein FliH  35.4 
 
 
200 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.576536  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  25 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  25.68 
 
 
303 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  32.67 
 
 
533 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2715  hypothetical protein  20.74 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  23.04 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  29.65 
 
 
252 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  18.66 
 
 
308 aa  42.4  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25 
 
 
224 aa  42.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  17.78 
 
 
306 aa  42.4  0.008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  26.29 
 
 
268 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  31.68 
 
 
533 aa  42  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>