31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2670 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2670  flagellar assembly protein FliH, putative  100 
 
 
250 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2289  flagellar assembly protein FliH, putative  61.26 
 
 
254 aa  294  7e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0351  flagellar assembly protein FliH, putative  54.92 
 
 
246 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1570  hypothetical protein  36.81 
 
 
640 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.168209  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3031  flagellar assembly protein FliH  32.68 
 
 
232 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.715642  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3097  flagellar assembly protein FliH  29.22 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  32.04 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  24.86 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  27.27 
 
 
280 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  27.78 
 
 
242 aa  52  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  19.59 
 
 
308 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0705  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  23.98 
 
 
236 aa  49.3  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1335  flagellar assembly protein FliH  27.42 
 
 
286 aa  48.5  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  26.55 
 
 
304 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1595  flagellar assembly protein FliH, putative  40.48 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2171  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  25.13 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  25.32 
 
 
228 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  28.14 
 
 
266 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  23.33 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  28.24 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  27.65 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  21.6 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  22.98 
 
 
334 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  28.34 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  28.66 
 
 
255 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  27.46 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  22.75 
 
 
318 aa  42.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  22.28 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  24.42 
 
 
300 aa  42.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  29.61 
 
 
278 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  28.42 
 
 
254 aa  42  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>