33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0351 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0351  flagellar assembly protein FliH, putative  100 
 
 
246 aa  497  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2670  flagellar assembly protein FliH, putative  54.92 
 
 
250 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2289  flagellar assembly protein FliH, putative  50 
 
 
254 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1570  hypothetical protein  31.58 
 
 
640 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.168209  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3031  flagellar assembly protein FliH  24.39 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.715642  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  23.81 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  25.47 
 
 
334 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  23.12 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  29.76 
 
 
304 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  26.74 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0705  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  22.63 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  20.79 
 
 
280 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  28.76 
 
 
267 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  24.53 
 
 
324 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.16 
 
 
242 aa  48.5  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2273  flagellar assembly protein FliH  26.32 
 
 
296 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.362027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  28.1 
 
 
268 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1335  flagellar assembly protein FliH  24.12 
 
 
286 aa  45.4  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.23 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  24.05 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  23.31 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  23.37 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  23.89 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  22.49 
 
 
316 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  22.44 
 
 
306 aa  43.5  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  21.69 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  24.69 
 
 
293 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  24.85 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  25.48 
 
 
300 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0220  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  22.12 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  29.29 
 
 
266 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  26.83 
 
 
296 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  23.46 
 
 
269 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>