67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0220 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0220  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  100 
 
 
263 aa  519  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1593  flagellar assembly protein H  37.98 
 
 
290 aa  181  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0365  flagellar assembly protein H  39.34 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0265  flagellar assembly protein H  41.98 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0342  flagellar assembly protein H  38.97 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1643  flagellar assembly protein H  38.24 
 
 
276 aa  171  9e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18558  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1356  flagellar assembly protein H  35.96 
 
 
272 aa  154  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0474  flagellar assembly protein H  32.05 
 
 
264 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  31.43 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  30.11 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  31.74 
 
 
242 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  27.75 
 
 
261 aa  59.3  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  26.09 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  28.74 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  23.75 
 
 
201 aa  56.2  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  27.78 
 
 
266 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  24.39 
 
 
247 aa  55.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  27.61 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  24.73 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  24.73 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  24.73 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  28.74 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  27.11 
 
 
228 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  26.01 
 
 
231 aa  52.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  25.31 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  27.11 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  25.31 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  24.84 
 
 
295 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  25.31 
 
 
228 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  25.31 
 
 
228 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.14 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  26.83 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  25.13 
 
 
316 aa  49.7  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  27.71 
 
 
263 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  24.38 
 
 
227 aa  48.9  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  23.3 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  24.36 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  27.54 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  24.32 
 
 
320 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  22.6 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  22.6 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  22.6 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  22.6 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  24.38 
 
 
307 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  22.6 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  23.23 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  24.32 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  25.61 
 
 
252 aa  45.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  25.97 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  27.01 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  25 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  22.29 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  25 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.62 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  30.77 
 
 
296 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  25 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  24.19 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2561  flagellar assembly protein FliH  27.27 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00219056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  22.15 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  20.89 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  20.89 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  23.24 
 
 
316 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2465  flagellar assembly protein FliH  28.28 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000780406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  26.51 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0351  flagellar assembly protein FliH, putative  22.12 
 
 
246 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  23.24 
 
 
316 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1392  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  27.27 
 
 
211 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0445381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>