159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2823 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  100 
 
 		 266 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  68.82 
 
 		 267 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  66.92 
 
 		 268 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  59.62 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  60.38 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  59.18 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  58.94 
 
 		 263 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  58.67 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  59.32 
 
 		 264 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  55.6 
 
 		 268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  37.26 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  34.68 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  33.2 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  35.03 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  28.57 
 
 		 349 aa  102  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  33 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  32.28 
 
 		 233 aa  89  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.74 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  27.13 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  32.04 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 		 300 aa  85.1  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  27.69 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  31.25 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  27.78 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  27.78 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  29.03 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  27 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  32.78 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  31.93 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  31.98 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  26.34 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  25.6 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  27.97 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  24.62 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  27.16 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  24.39 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  29.11 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  32.58 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  31.25 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  25.69 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  24.24 
 
 		 338 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  24.24 
 
 		 338 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  27.18 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  28.14 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  28.22 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  28.22 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  24.24 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  26.42 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  26.97 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  26.32 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  26.71 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  29.75 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  26.05 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  26.38 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  24.38 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  26.71 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3563  flagellar assembly protein FliH  22.03 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  30.51 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  24.68 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  25.97 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  26.11 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  30.39 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  26.04 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  29.78 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  25.81 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  26.13 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  24.22 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  26.45 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  29.07 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  30.94 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  29.51 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  30 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  22.1 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  26.23 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  30.17 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  28.76 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  26.83 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  26.98 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  25.14 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  24.68 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  26.63 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1722  polar flagellar assembly protein FliH  23.33 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  24.71 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.23 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  24.53 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  26.86 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1722  polar flagellar assembly protein FliH  22.78 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  23.95 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  25 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  25 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  26.67 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  25.88 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0220  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  27.17 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  22.92 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  27.45 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  21.52 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  25.43 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.19 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  27.17 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  30.16 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>