165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1967 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 		 242 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  50.85 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  38.2 
 
 		 295 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  34.26 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  39.11 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  37.43 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  37.99 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  39.33 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  36.52 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  37.57 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  28.27 
 
 		 334 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  36.99 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  36.53 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  37.21 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  35.03 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  36.05 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  29.48 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  32.91 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  40.12 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  26.67 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  32.88 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  27.64 
 
 		 316 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  27.78 
 
 		 266 aa  92.4  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  29.82 
 
 		 270 aa  92.4  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  29.46 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  34.97 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  27.24 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  27.2 
 
 		 260 aa  89.4  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  28.14 
 
 		 324 aa  89.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  32.76 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  25.91 
 
 		 316 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  27.5 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  31.55 
 
 		 339 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  25.91 
 
 		 316 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  28.57 
 
 		 316 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  26.07 
 
 		 403 aa  86.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  31.7 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  27.35 
 
 		 338 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  27.35 
 
 		 338 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  27.76 
 
 		 318 aa  85.9  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  35.78 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  26.94 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  29.79 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  26.94 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  31.21 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  34.88 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  29.09 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  29.87 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  33.66 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  34.48 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  34.78 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  31.46 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  30.22 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  30.45 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  29.67 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  34.78 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  31.68 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  31.41 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  27.94 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  31.41 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  29.67 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  35.26 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  29.27 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  32.69 
 
 		 375 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  32.18 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  33.79 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  24.24 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  34.55 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  33.79 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  32.41 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  33.1 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  32.08 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1722  polar flagellar assembly protein FliH  27.68 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1722  polar flagellar assembly protein FliH  27.12 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  25 
 
 		 349 aa  71.6  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  28.81 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  27.93 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  34.59 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  31.41 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  30.52 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  29.21 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  26.47 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  30.86 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2452  flagellar assembly protein H  33.79 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0964661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  30.86 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3066  flagellar assembly protein H  33.79 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00102567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  30.92 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  30 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  30.32 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  30.32 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  30.32 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  30.32 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  30.32 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  30.32 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  31.28 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  31.93 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  28.67 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  30.26 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  28.66 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  29.3 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>