21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2273 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2273  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 		 296 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.362027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  27.2 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  22.64 
 
 		 300 aa  52.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  19.1 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  29.51 
 
 		 304 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  30.81 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  42.34 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  28.67 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.39 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  29.8 
 
 		 231 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0351  flagellar assembly protein FliH, putative  26.32 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  26.29 
 
 		 252 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  24.61 
 
 		 252 aa  46.2  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  29.57 
 
 		 241 aa  45.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  24.26 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.36 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  32.5 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  25 
 
 		 212 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  25 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  22.28 
 
 		 238 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  27.82 
 
 		 205 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>