164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0571 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  100 
 
 		 242 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  34.73 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  30.07 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.53 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  30.63 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  33.62 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  31.37 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  33.13 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  29.93 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  26.78 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3428  flagellar assembly protein fliH, putative  26.8 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  31.48 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  30.06 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  30 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.39 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  30.86 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  29.56 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  28.12 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  34.19 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  25.93 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  33.1 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  29.17 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  31.97 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  32.32 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  32.68 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3097  flagellar assembly protein FliH  28.91 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  29.68 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  24.79 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  32.69 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  31.73 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  27.33 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1392  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  30 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0445381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  30.52 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  32.05 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  32.05 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  32.05 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  32.05 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  32.05 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  32.05 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  32.05 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  29.63 
 
 		 224 aa  62  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  30.49 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  30.06 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  31.73 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  31.45 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  29.3 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  25.77 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0220  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  31.74 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  29.49 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  35.92 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  28 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  27.88 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  34.62 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  31.68 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  28.43 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  28.43 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  28.43 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  28.43 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  28.43 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1650  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  25.76 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.31 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  32.69 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  24.9 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  27.75 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  23.84 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0040  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  33.66 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  24.9 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2561  flagellar assembly protein FliH  31.82 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00219056  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  31.25 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  24.9 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  29.81 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  26.38 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  31.84 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  37.62 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2465  flagellar assembly protein FliH  28.7 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000780406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  30.77 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  30.77 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  30.77 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  30.77 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.83 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  30.77 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  30.86 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2005  flagellar assembly protein H  26.97 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  33.64 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  33.64 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  27.52 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  33.52 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  30 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  28.49 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  29.73 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  27.52 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1691  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  18.35 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  31.11 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  29.7 
 
 		 338 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  32.73 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  26.17 
 
 		 316 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  32.18 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  32.76 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  28.92 
 
 		 303 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>