48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2356 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2356  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 
200 aa  339  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.576536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2268  flagellar assembly protein FliH  97.5 
 
 
200 aa  260  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1595  flagellar assembly protein FliH, putative  88.5 
 
 
200 aa  241  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2217  flagellar assembly protein FliH, putative  65.49 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174846  hitchhiker  0.00568244 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  41.01 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  25.25 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  24.15 
 
 
263 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  34.84 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  33.97 
 
 
238 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  23.83 
 
 
306 aa  64.3  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  27.41 
 
 
255 aa  62.8  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  22.11 
 
 
258 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  26.7 
 
 
249 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  39.39 
 
 
231 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1593  flagellar assembly protein H  25.95 
 
 
290 aa  57  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  26.28 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  24.14 
 
 
300 aa  57  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3097  flagellar assembly protein FliH  36.28 
 
 
255 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  30.82 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  30.86 
 
 
257 aa  54.7  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  29.33 
 
 
205 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  34.82 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  30.12 
 
 
304 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  28.48 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  32.47 
 
 
293 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  32.92 
 
 
243 aa  52  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  24.06 
 
 
280 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  25 
 
 
262 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  27.33 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3428  flagellar assembly protein fliH, putative  28.07 
 
 
250 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  24.49 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  24.24 
 
 
308 aa  49.7  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  33.87 
 
 
295 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  41.67 
 
 
268 aa  48.5  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  24.62 
 
 
212 aa  48.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42250  type III secretion system protein  32.32 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399821  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  34.02 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  36.65 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  28.3 
 
 
300 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2670  flagellar assembly protein FliH, putative  34.76 
 
 
250 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  24.19 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  33.53 
 
 
255 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3746  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  33.33 
 
 
209 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212499  hitchhiker  0.00667574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  35.14 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0220  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  24.42 
 
 
263 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1392  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  36.54 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0445381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  30.37 
 
 
262 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0705  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  24.61 
 
 
236 aa  42.4  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>