83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3428 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3428  flagellar assembly protein fliH, putative  100 
 
 
250 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  44.18 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  37.55 
 
 
293 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  34.78 
 
 
304 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  34.52 
 
 
269 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  37.43 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  36.09 
 
 
237 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  31.06 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.8 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  29.52 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1650  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  23.81 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512171  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  29.14 
 
 
300 aa  64.7  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  30 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  27.5 
 
 
308 aa  58.9  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  27.44 
 
 
249 aa  58.5  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  27.69 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  27.16 
 
 
334 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  28.3 
 
 
318 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  28.49 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  25.49 
 
 
307 aa  55.8  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  27.65 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1691  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  18.49 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  28.29 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  26.71 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.19 
 
 
224 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  29.59 
 
 
338 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  28.95 
 
 
272 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  31.3 
 
 
267 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  33.33 
 
 
244 aa  52  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  33.33 
 
 
244 aa  52  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  23.6 
 
 
316 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  28.99 
 
 
338 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  30.97 
 
 
338 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  28.95 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  27.33 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  24.67 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  24.39 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  30.97 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0265  flagellar assembly protein H  22.49 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2171  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  24.83 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  21.6 
 
 
324 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  26.56 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  26.18 
 
 
264 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.79 
 
 
263 aa  49.3  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  25.54 
 
 
266 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  29.36 
 
 
303 aa  48.5  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  25.23 
 
 
268 aa  48.5  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  29.66 
 
 
254 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  23.35 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  27.56 
 
 
300 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  22.47 
 
 
316 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  32.32 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  24.05 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  24.87 
 
 
255 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  25.88 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  26.94 
 
 
263 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1595  flagellar assembly protein FliH, putative  27.19 
 
 
200 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  21.62 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  26.62 
 
 
270 aa  45.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  24.05 
 
 
238 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  24.05 
 
 
238 aa  45.4  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  21.02 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  25.64 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  24.38 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.16 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1593  flagellar assembly protein H  27.93 
 
 
290 aa  44.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  26.03 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  28.75 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  23.27 
 
 
233 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  26.72 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  26.45 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  29.81 
 
 
375 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  26.67 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  25.53 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2268  flagellar assembly protein FliH  28.07 
 
 
200 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  22.02 
 
 
339 aa  42.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  25.64 
 
 
255 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  22.36 
 
 
236 aa  42.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1356  flagellar assembly protein H  23.03 
 
 
272 aa  42  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  25.88 
 
 
205 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  28.83 
 
 
237 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  25 
 
 
252 aa  42  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>