42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1991 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0423  type III secretion system protein HrpB  100 
 
 		 289 aa  544  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00673327  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1991  type III secretion system protein HrpB  100 
 
 		 277 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1899  type III secretion system protein HrpB  100 
 
 		 270 aa  527  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5938  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  40.87 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0745  type III secretion system protein HrpB  46.01 
 
 		 238 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0685  type III secretion system protein HrpB  47.32 
 
 		 238 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129872  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0628  type III secretion system protein HrpB  46.83 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2204  type III secretion system protein HrpB  46.83 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1636  type III secretion system protein HrpB  47.98 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2287  type III secretion system protein HrpB  47.98 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0183918  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5852  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  38.72 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1949  type III secretion system protein HrpB  47.47 
 
 		 215 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238143  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5635  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  41.74 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0813541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03397  type III secretion system protein HrpB  31 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  26.74 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0464  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  33.16 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  28.35 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0869  type III secretion system protein HrpB  32.73 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371286  decreased coverage  0.00150472 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4848  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  32.83 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4745  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  33.84 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.528631 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3518  Type III secretion system HrpE/YscL  32.83 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253777  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5436  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  32.83 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0949322  normal  0.0915809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4223  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  33.84 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3746  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  32.47 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212499  hitchhiker  0.00667574 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.15 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42250  type III secretion system protein  27.6 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  25.67 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  31.45 
 
 		 205 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3124  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein like  33.61 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0778311  hitchhiker  0.00270751 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  23.39 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  24.26 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  23 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  29.02 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  20.21 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  19.57 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2715  hypothetical protein  20.83 
 
 		 290 aa  45.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  56.76 
 
 		 205 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  24.49 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  22.58 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  26.79 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  23.04 
 
 		 267 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>