28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3124 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3124  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein like  100 
 
 		 318 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0778311  hitchhiker  0.00270751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5214  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  49.58 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  43.55 
 
 		 2449 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3746  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  35.29 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212499  hitchhiker  0.00667574 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  52.27 
 
 		 1594 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4745  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  32.87 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.528631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4223  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  32.17 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  29.59 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  34.86 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0423  type III secretion system protein HrpB  31.82 
 
 		 289 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00673327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  36.99 
 
 		 1281 aa  52.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  34.58 
 
 		 205 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4848  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  30.77 
 
 		 209 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3518  Type III secretion system HrpE/YscL  30.77 
 
 		 209 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253777  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5436  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  30.77 
 
 		 209 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0949322  normal  0.0915809 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1991  type III secretion system protein HrpB  31.82 
 
 		 277 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5938  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  31.33 
 
 		 289 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1899  type III secretion system protein HrpB  31.82 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  25.35 
 
 		 212 aa  49.7  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  28.57 
 
 		 211 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2082  hypothetical protein  63.89 
 
 		 1703 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112234 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  49.3 
 
 		 1217 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  43.55 
 
 		 793 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  28.74 
 
 		 2397 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  33.82 
 
 		 2313 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34250  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  47.46 
 
 		 850 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.137913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42250  type III secretion system protein  27.08 
 
 		 214 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1595  flagellar assembly protein FliH, putative  36 
 
 		 200 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>