38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5852 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5852  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  100 
 
 		 335 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5635  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  95.22 
 
 		 335 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0813541 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0423  type III secretion system protein HrpB  37.98 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00673327  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1899  type III secretion system protein HrpB  38.72 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1991  type III secretion system protein HrpB  37.7 
 
 		 277 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5938  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  38.8 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0745  type III secretion system protein HrpB  40.72 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0685  type III secretion system protein HrpB  40.27 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129872  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0628  type III secretion system protein HrpB  39.82 
 
 		 240 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2287  type III secretion system protein HrpB  39.82 
 
 		 238 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0183918  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2204  type III secretion system protein HrpB  39.82 
 
 		 240 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1636  type III secretion system protein HrpB  39.82 
 
 		 238 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1949  type III secretion system protein HrpB  44.67 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03397  type III secretion system protein HrpB  35.95 
 
 		 233 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0869  type III secretion system protein HrpB  39.22 
 
 		 301 aa  94.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371286  decreased coverage  0.00150472 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0464  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  37.85 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3746  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  30.59 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212499  hitchhiker  0.00667574 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  24.44 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  29.25 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4745  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  33.12 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.528631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4223  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  33.12 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4848  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  28.96 
 
 		 209 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3518  Type III secretion system HrpE/YscL  28.96 
 
 		 209 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253777  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5436  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  28.96 
 
 		 209 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0949322  normal  0.0915809 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  23.7 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  29.33 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42250  type III secretion system protein  32.46 
 
 		 214 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  22.92 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  21.26 
 
 		 262 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  22.52 
 
 		 308 aa  47  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  27.83 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  25.59 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1289  hypothetical protein  32.48 
 
 		 217 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.630494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  35.14 
 
 		 242 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  30.84 
 
 		 245 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  26.74 
 
 		 304 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  21.14 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2715  hypothetical protein  21.2 
 
 		 290 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>