41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2287 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1636  type III secretion system protein HrpB  100 
 
 		 238 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0685  type III secretion system protein HrpB  99.58 
 
 		 238 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129872  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0628  type III secretion system protein HrpB  100 
 
 		 240 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2204  type III secretion system protein HrpB  100 
 
 		 240 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2287  type III secretion system protein HrpB  100 
 
 		 238 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0183918  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1949  type III secretion system protein HrpB  99.53 
 
 		 215 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238143  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0745  type III secretion system protein HrpB  94.14 
 
 		 238 aa  360  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0423  type III secretion system protein HrpB  45.8 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00673327  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1899  type III secretion system protein HrpB  47.69 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1991  type III secretion system protein HrpB  47.69 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5938  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  40.59 
 
 		 289 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5852  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  40.95 
 
 		 335 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5635  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  40.09 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0813541 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0869  type III secretion system protein HrpB  39.71 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371286  decreased coverage  0.00150472 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  27.18 
 
 		 300 aa  68.6  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  25.27 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3746  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  28.76 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212499  hitchhiker  0.00667574 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4848  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  30.77 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3518  Type III secretion system HrpE/YscL  30.77 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253777  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5436  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  30.77 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0949322  normal  0.0915809 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4745  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  31.07 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.528631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4223  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  31.07 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03397  type III secretion system protein HrpB  30.67 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  24.19 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  47.14 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  42.86 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  20.22 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  24.37 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42250  type III secretion system protein  27.93 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  23.28 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  20.13 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  22.93 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1335  flagellar assembly protein FliH  29.11 
 
 		 286 aa  45.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  21.31 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  31.28 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2217  flagellar assembly protein FliH, putative  44.3 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174846  hitchhiker  0.00568244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1691  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  20.41 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0464  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  31.88 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  27.38 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2715  hypothetical protein  20.41 
 
 		 290 aa  42  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2005  flagellar assembly protein H  25 
 
 		 256 aa  42  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>