159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1368 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 		 339 aa  682    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  48.8 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  57.26 
 
 		 320 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  55.42 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  55.02 
 
 		 338 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  55.02 
 
 		 338 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  57.26 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  56.85 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  56.85 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  54.62 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  51.55 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  48.69 
 
 		 318 aa  275  6e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  51.47 
 
 		 316 aa  269  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  45.79 
 
 		 403 aa  257  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  51.63 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  46.94 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  36.36 
 
 		 260 aa  152  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  36.73 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  35.17 
 
 		 262 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  32.33 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  35.82 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  34.72 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  33.19 
 
 		 265 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  39.39 
 
 		 243 aa  123  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  35.03 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  34.98 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  30.62 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  30.73 
 
 		 278 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  31.46 
 
 		 242 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  32.66 
 
 		 263 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  34.17 
 
 		 254 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  30.96 
 
 		 272 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 		 238 aa  89.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  32.08 
 
 		 267 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  32.08 
 
 		 268 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 		 238 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  30.69 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  33.67 
 
 		 264 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  30.96 
 
 		 272 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  33.67 
 
 		 260 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  27.41 
 
 		 349 aa  86.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 		 238 aa  86.3  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  36.26 
 
 		 228 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  32.32 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  33.15 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  35.88 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  35.88 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  31.05 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  35.88 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  35.88 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  31.82 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  35.88 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  30.41 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  32.79 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  30.96 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  29.81 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  29.32 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  32.31 
 
 		 252 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  28.94 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  32.91 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  29.55 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  29.55 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  29.55 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  28.34 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  31.74 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  29.67 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  36.53 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  26.96 
 
 		 206 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  26.96 
 
 		 206 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  26.92 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  28.94 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  35.26 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  35.26 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  35.26 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  35.26 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  35.26 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  28.42 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  30.06 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  24.18 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  28.96 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  28.5 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  29.2 
 
 		 241 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  25.85 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  32.32 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  29.65 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  27.39 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  28.32 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  31.18 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  27.1 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  34.41 
 
 		 237 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  29.56 
 
 		 227 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  30.64 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  28.35 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  28.4 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  28.4 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  28.4 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  28.4 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  28.4 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  32.09 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  30.77 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>