146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1326 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  100 
 
 
375 aa  759    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  43.77 
 
 
403 aa  309  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  55.06 
 
 
324 aa  279  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  53.39 
 
 
320 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  50.4 
 
 
316 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  50.4 
 
 
316 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  51.46 
 
 
334 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  51.65 
 
 
338 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  51.24 
 
 
338 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  51.24 
 
 
338 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  51.24 
 
 
338 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  52.07 
 
 
318 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  50 
 
 
316 aa  257  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  50.41 
 
 
316 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  44.62 
 
 
300 aa  239  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  46.94 
 
 
339 aa  236  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  35 
 
 
262 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  35.02 
 
 
270 aa  149  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  32.94 
 
 
265 aa  144  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  33.47 
 
 
266 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  33.88 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  32.31 
 
 
266 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  32.64 
 
 
260 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  33.99 
 
 
307 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  31.63 
 
 
295 aa  119  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  30.95 
 
 
296 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  27.44 
 
 
349 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  30.67 
 
 
243 aa  93.6  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  32.69 
 
 
242 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  34.94 
 
 
233 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  29.51 
 
 
230 aa  87  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  27.52 
 
 
238 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  27.52 
 
 
238 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  36.09 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  28.02 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  27.84 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  28.11 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  31.28 
 
 
226 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  27.69 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  26.82 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  27.81 
 
 
228 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  28.87 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  31.02 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  29.27 
 
 
231 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  26.63 
 
 
268 aa  75.5  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  31 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  27.04 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  27.22 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  27.22 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  29.95 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  27.22 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  27.22 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  28.06 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  27.22 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  24.43 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  28.92 
 
 
251 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  26.24 
 
 
224 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  23.81 
 
 
236 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  26.98 
 
 
251 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  24.23 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  28.69 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  26.83 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  27.75 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  26.25 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  23.73 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  24.61 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  28.11 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  23.81 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  26.38 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  24.54 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  24.54 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  30.77 
 
 
252 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  26.22 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  26.32 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3563  flagellar assembly protein FliH  25.54 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  26.28 
 
 
227 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  24.39 
 
 
227 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  30.36 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  23.16 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  23.16 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  23.16 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  23.16 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  23.16 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  23.16 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  23.53 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  24.39 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  26.28 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  23.16 
 
 
226 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  26.32 
 
 
238 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  26.32 
 
 
238 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  26.74 
 
 
235 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  26.74 
 
 
235 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  26.74 
 
 
235 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  26.74 
 
 
235 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  26.74 
 
 
235 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 
238 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  24.85 
 
 
241 aa  62.8  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  24.85 
 
 
240 aa  62.8  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  26.92 
 
 
201 aa  62.8  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>