106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0435 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  100 
 
 
260 aa  511  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  35.8 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  29.11 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  30.85 
 
 
296 aa  89.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  27.46 
 
 
316 aa  87.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  27.43 
 
 
324 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  30.42 
 
 
338 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  29.06 
 
 
316 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  27.1 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  28.4 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  28.63 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  26.54 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  29.96 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  27.39 
 
 
339 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  30.04 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  30.04 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  27.12 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  27.82 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  26.47 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  27.44 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  26.24 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  27.69 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  25.87 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  31.25 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  31.76 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  26.15 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  25.43 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  23.02 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  28.51 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  24.8 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  24.07 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  29.21 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  27.17 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  26.32 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  31.22 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  30.46 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  30.46 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  29.13 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  24.68 
 
 
403 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  23.98 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  31.25 
 
 
228 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  29.94 
 
 
213 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  21.51 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  27.71 
 
 
272 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  30.43 
 
 
231 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  31.9 
 
 
261 aa  62.4  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  28 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  30.51 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  30.98 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  32.94 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  29.6 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  30.81 
 
 
228 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  30.81 
 
 
228 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  30.81 
 
 
228 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  30.81 
 
 
228 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  30.81 
 
 
228 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  30.39 
 
 
233 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  28.78 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  25.64 
 
 
262 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  25.71 
 
 
227 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  25.56 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  29.21 
 
 
209 aa  56.6  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  26.15 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  27.93 
 
 
234 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  26.44 
 
 
227 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  28.33 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  31.36 
 
 
201 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  28.73 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  28.73 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  28.73 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  28.73 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  28.73 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  28.73 
 
 
226 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  25.7 
 
 
227 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  28.73 
 
 
226 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  25.45 
 
 
349 aa  52.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  24.77 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  28.12 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  28.92 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  24.55 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  25.95 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.01 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1722  polar flagellar assembly protein FliH  20.12 
 
 
212 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  29.44 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1722  polar flagellar assembly protein FliH  20.12 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0351  flagellar assembly protein FliH, putative  28.06 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  24.53 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  24.53 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  29.81 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 
235 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 
235 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 
235 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 
235 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  31.19 
 
 
237 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 
235 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  25.34 
 
 
244 aa  45.4  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  30.46 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2289  flagellar assembly protein FliH, putative  27.32 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  25.34 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>