148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2134 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  100 
 
 
235 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  99.57 
 
 
235 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  100 
 
 
235 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  100 
 
 
235 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  100 
 
 
235 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  79.08 
 
 
236 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  81.28 
 
 
228 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  81.7 
 
 
228 aa  344  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353539 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  81.7 
 
 
228 aa  344  7e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  81.28 
 
 
228 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  81.28 
 
 
228 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  80.43 
 
 
228 aa  337  9e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  56.97 
 
 
251 aa  257  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  61.44 
 
 
234 aa  255  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  54.27 
 
 
231 aa  248  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  55.79 
 
 
238 aa  238  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  55.79 
 
 
238 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  55.79 
 
 
238 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  57.02 
 
 
240 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  57.02 
 
 
241 aa  231  9e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  37.78 
 
 
278 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  34.93 
 
 
245 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  38.32 
 
 
252 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  33.71 
 
 
255 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  36.52 
 
 
207 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  35.96 
 
 
226 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  35.96 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  37.57 
 
 
227 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  35.39 
 
 
226 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  35.39 
 
 
226 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  35.39 
 
 
226 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  35.39 
 
 
226 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  35.39 
 
 
226 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  37.17 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  37.02 
 
 
227 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  37.02 
 
 
227 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  37.42 
 
 
227 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  37.02 
 
 
225 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  37.42 
 
 
227 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  36.11 
 
 
237 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  36.13 
 
 
227 aa  98.6  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  30.77 
 
 
320 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  33.75 
 
 
245 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  33.75 
 
 
245 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 
318 aa  92.4  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  29.67 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  30.22 
 
 
316 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  34.55 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  29.67 
 
 
316 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  31.32 
 
 
338 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  31.32 
 
 
338 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  31.32 
 
 
338 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  31.32 
 
 
338 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  32.5 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2452  flagellar assembly protein H  36.77 
 
 
227 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0964661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3066  flagellar assembly protein H  36.77 
 
 
227 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00102567  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  27 
 
 
334 aa  88.6  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  31.84 
 
 
295 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  35.26 
 
 
339 aa  85.9  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  27.33 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  29.94 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  29.17 
 
 
316 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  27.81 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  33.33 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  26.84 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  30.39 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  30.22 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  26.8 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  27.19 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  26.86 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  29.41 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  26.37 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  26.44 
 
 
307 aa  72  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  25.15 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  26.84 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  29.24 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  30.39 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  27.68 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  26.87 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  24.12 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  26.9 
 
 
375 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  24.72 
 
 
209 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  31.65 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  25.1 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  26.7 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  27.92 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  25.95 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  22.64 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  26.79 
 
 
242 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  24.7 
 
 
251 aa  62.4  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  28.49 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  27.56 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  26.58 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  23.56 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  27.22 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  26.4 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  27.23 
 
 
276 aa  58.5  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  22.29 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  22.29 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  24.84 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>