143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2577 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  100 
 
 
241 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  92.95 
 
 
240 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  71.37 
 
 
251 aa  348  6e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  62.24 
 
 
231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  64.46 
 
 
234 aa  278  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  60.16 
 
 
238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  60.16 
 
 
238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  60.16 
 
 
238 aa  268  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  58.37 
 
 
228 aa  246  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  54.81 
 
 
236 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  57.51 
 
 
228 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  57.51 
 
 
228 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  57.51 
 
 
228 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353539 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  58.8 
 
 
228 aa  229  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  57.33 
 
 
228 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  57.02 
 
 
235 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  57.02 
 
 
235 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  57.02 
 
 
235 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  57.02 
 
 
235 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  57.02 
 
 
235 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  29.26 
 
 
252 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  31.42 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  36.53 
 
 
278 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  33.71 
 
 
255 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  30.67 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  31.46 
 
 
207 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  30.9 
 
 
226 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  32.91 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  33.13 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  32.42 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  30.29 
 
 
316 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  31.9 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  30.34 
 
 
226 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  30.34 
 
 
226 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  30.34 
 
 
226 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  30.34 
 
 
226 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  30.34 
 
 
226 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  32 
 
 
338 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  30.29 
 
 
318 aa  92  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  30.48 
 
 
227 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  32 
 
 
338 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  32.42 
 
 
227 aa  92  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  27.63 
 
 
320 aa  92  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  30.34 
 
 
226 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  32 
 
 
338 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  32 
 
 
338 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  32.28 
 
 
227 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  29.71 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  30.87 
 
 
237 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  28.98 
 
 
248 aa  88.6  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  30.39 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  29.38 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  29.38 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  26.32 
 
 
316 aa  85.9  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  26.09 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2452  flagellar assembly protein H  33.13 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0964661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3066  flagellar assembly protein H  33.13 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00102567  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  30.06 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  26.19 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  29.2 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  25.43 
 
 
324 aa  79  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  28.16 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  26.67 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  23.48 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  26.92 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  29.11 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  23.08 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  25 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  25.1 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  28.57 
 
 
201 aa  72  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  28.32 
 
 
261 aa  72  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  26.67 
 
 
262 aa  72  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  25.63 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  27.17 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  23.43 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  25.11 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  25.75 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  26.83 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  26.95 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  30.13 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  25.77 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  25.49 
 
 
268 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  24.02 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  23.6 
 
 
300 aa  62.8  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  24.71 
 
 
349 aa  62.8  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  23.57 
 
 
264 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  23.81 
 
 
262 aa  62  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  26.55 
 
 
235 aa  62  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  22.98 
 
 
260 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  22.93 
 
 
263 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0474  flagellar assembly protein H  26.74 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  25 
 
 
375 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  24.47 
 
 
266 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  25.43 
 
 
252 aa  58.9  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  25.95 
 
 
224 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  22.29 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  25.56 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  22.32 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  23.6 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  21.11 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>