143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3657 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  100 
 
 		 235 aa  473  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  71.06 
 
 		 236 aa  338  5e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  68.94 
 
 		 235 aa  333  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  64.32 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  62.07 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  38.43 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  39.3 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  34.75 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  36.44 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  36.04 
 
 		 236 aa  138  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  36.44 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  36.04 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  36.67 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  35.19 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  34.72 
 
 		 242 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  29.89 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  30.32 
 
 		 295 aa  89  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  27.56 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  33.52 
 
 		 266 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  31.55 
 
 		 266 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  32.42 
 
 		 266 aa  85.9  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  33.88 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  30.36 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3563  flagellar assembly protein FliH  24.44 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  31.14 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  30.1 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  29.61 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  34.39 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  30.57 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  31.22 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  30 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  31.93 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  28.95 
 
 		 334 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  29.61 
 
 		 338 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  29.61 
 
 		 338 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  29.44 
 
 		 318 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  31.98 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  30.54 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  26.46 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  32.09 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  31.4 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  29.95 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  28.5 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  26.92 
 
 		 339 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  31.4 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  30.65 
 
 		 403 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  31.4 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  27.6 
 
 		 349 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  31.25 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  27.05 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  26.7 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  29.71 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  27.05 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  29.61 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  31.05 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  29.94 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  30.3 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  27.54 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  28.75 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  29.47 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  27.27 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.59 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  28.5 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  26.95 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  30.99 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  27.81 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  38.78 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  27.1 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  27.1 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  29.38 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  29.38 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  29.38 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  29.38 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  29.38 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  29.38 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  27.93 
 
 		 225 aa  62  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  29.38 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  29.95 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  29.27 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  29 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  26.23 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  27.08 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  29 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  27.08 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  28.5 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  28.5 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  28.5 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  28.49 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  26.37 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  29.7 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  24.71 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  24.71 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  24.71 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  26.84 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  26.84 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  26.84 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  26.84 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  26.84 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640019 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>