143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1184 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  100 
 
 		 403 aa  817    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  43.77 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  57.85 
 
 		 320 aa  288  9e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  57.55 
 
 		 316 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  54.3 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  57.44 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  57.44 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  50.19 
 
 		 334 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  50.55 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  50.55 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  50.55 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  50.18 
 
 		 338 aa  279  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  53.85 
 
 		 318 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  50.55 
 
 		 316 aa  270  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  49.17 
 
 		 339 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  49.21 
 
 		 300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  38.42 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  35.82 
 
 		 266 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  30.67 
 
 		 266 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  35.45 
 
 		 265 aa  133  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  33.48 
 
 		 262 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  29.05 
 
 		 266 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  32.11 
 
 		 260 aa  127  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  30.53 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  31.84 
 
 		 296 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  29.3 
 
 		 307 aa  103  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  30.77 
 
 		 243 aa  103  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  31.41 
 
 		 233 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  28.49 
 
 		 349 aa  86.3  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  29.15 
 
 		 268 aa  86.3  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  29.49 
 
 		 242 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  30.68 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  27.87 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  27.87 
 
 		 238 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  30 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  27.32 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  30.65 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  27.17 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  27.98 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  26.38 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  24.78 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  25.22 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  27.49 
 
 		 236 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  26.6 
 
 		 254 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  27.64 
 
 		 231 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  25.13 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  27.48 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  27.98 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  27.98 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  27.98 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  25.26 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  27.98 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  28.25 
 
 		 227 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  27.03 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  27.68 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  28.77 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  27.38 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  27.59 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  23.73 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  26.97 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  28.75 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  25.23 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  28.12 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  25.6 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  26.26 
 
 		 226 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  25.42 
 
 		 303 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  25.22 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  24.85 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  27.12 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  28.12 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  27.49 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  26.09 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  27.41 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  25 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  28.21 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  30.39 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  30.39 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  30.39 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  30.39 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  28.12 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  30.39 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  23.43 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  28.87 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  25.64 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  23.78 
 
 		 248 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  25.81 
 
 		 266 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  25.79 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  23.44 
 
 		 255 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  28.8 
 
 		 251 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  27.36 
 
 		 236 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  26.9 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  24.28 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  24.69 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  23.7 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2452  flagellar assembly protein H  28.75 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0964661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  24.69 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  23.7 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  23.7 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  23.7 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  23.7 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>