137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002817 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 
266 aa  545  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  94.36 
 
 
266 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  69.17 
 
 
270 aa  390  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  50.95 
 
 
265 aa  280  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  36.36 
 
 
262 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  34.02 
 
 
260 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  35.66 
 
 
324 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  32.78 
 
 
320 aa  142  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  30.28 
 
 
300 aa  138  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  33.06 
 
 
316 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  31.97 
 
 
316 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  31.97 
 
 
316 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  33.76 
 
 
339 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  34.17 
 
 
334 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  31.09 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  31.35 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  30.67 
 
 
403 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  29.25 
 
 
338 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  29.25 
 
 
338 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  29.25 
 
 
338 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  29.25 
 
 
338 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  30.36 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  34.71 
 
 
375 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  30.52 
 
 
295 aa  123  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  29.01 
 
 
243 aa  92.8  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  27.18 
 
 
296 aa  92.8  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  27.78 
 
 
242 aa  92.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  29.69 
 
 
252 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  32.97 
 
 
235 aa  89.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  30.27 
 
 
251 aa  89.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  33.52 
 
 
235 aa  87  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 
236 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  28.42 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  29.31 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  26.44 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  29.17 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  31.48 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  26.7 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.9 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  27.72 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  24.05 
 
 
238 aa  79  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  24.05 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  25.37 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  24.88 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  25.29 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  25.37 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  26.46 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  24.76 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  23.48 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  25.1 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  25.7 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  24.39 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  25.13 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  27.45 
 
 
224 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  27.27 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  22.1 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  25.52 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  27.84 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  27.46 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1722  polar flagellar assembly protein FliH  23.31 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1722  polar flagellar assembly protein FliH  23.31 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  26.06 
 
 
231 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  27.27 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  24.7 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  25.79 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  26.56 
 
 
236 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  24.43 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  26.58 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  26.42 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  26.04 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  26.74 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  22.28 
 
 
226 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  25.67 
 
 
242 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  26.74 
 
 
227 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  22.81 
 
 
238 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  22.81 
 
 
238 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  22.81 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  24.73 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  23.21 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0055  flagellar protein FliH  27.7 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  25 
 
 
227 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  26.92 
 
 
227 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  23.53 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  25.31 
 
 
201 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  26.11 
 
 
207 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  23.53 
 
 
272 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  25.71 
 
 
248 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  24.84 
 
 
206 aa  59.3  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  24.84 
 
 
206 aa  59.3  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  25.65 
 
 
226 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  25.13 
 
 
226 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  25.13 
 
 
226 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  25.13 
 
 
226 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  25.13 
 
 
226 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  25.13 
 
 
226 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  24.57 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  24.57 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  26.92 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  22.99 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  24.24 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>