143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3455 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  100 
 
 		 272 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  93.38 
 
 		 272 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  66.42 
 
 		 268 aa  322  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  65.56 
 
 		 260 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  65.78 
 
 		 264 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  68.65 
 
 		 254 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  61.98 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  60.47 
 
 		 267 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  57.69 
 
 		 266 aa  294  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  57.58 
 
 		 268 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  37.21 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  42.2 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  32.79 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  36 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  30.42 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  31.44 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  29.08 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  30.59 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  33.5 
 
 		 233 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  28.92 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  31.65 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  27.69 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  30.15 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  25.63 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  29.56 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  27.64 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  28.12 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  30.9 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  29.06 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  29.06 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  29.06 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  26.26 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  29.74 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  24.28 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  27.8 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  27.27 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  29.74 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  28.72 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  25.7 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  29.48 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  27.03 
 
 		 403 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  27.06 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  26.05 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  28.1 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  26.59 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  22.56 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  26.06 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  26.06 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  26.05 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  27.19 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  27.27 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  29.07 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  26.95 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  26.52 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  25.68 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  27.01 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  25.41 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  26.54 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  23.89 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  23.53 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  29.61 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  26.34 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  26.34 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  29.14 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  23.27 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  23.12 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  27.72 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  22.88 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.9 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  23.42 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  24.46 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3428  flagellar assembly protein fliH, putative  26.29 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  28.57 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  26.09 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  27.44 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  27.53 
 
 		 293 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  21.86 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  26.11 
 
 		 207 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  26.83 
 
 		 225 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  25.69 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  22.79 
 
 		 238 aa  52  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  22.79 
 
 		 238 aa  52  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  26.28 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  25.25 
 
 		 375 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3563  flagellar assembly protein FliH  21.71 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  22.79 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  23.62 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  28.05 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  28.03 
 
 		 201 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  22.7 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  22.36 
 
 		 231 aa  49.7  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  23.57 
 
 		 228 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  25.29 
 
 		 227 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  27.22 
 
 		 238 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  27.01 
 
 		 300 aa  48.9  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  27.44 
 
 		 227 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491071 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>