137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2186 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  100 
 
 		 349 aa  705    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  29.59 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  32.64 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  31.44 
 
 		 296 aa  99.4  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  30.61 
 
 		 254 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  28.74 
 
 		 272 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  31.25 
 
 		 268 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  27.44 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  30.73 
 
 		 268 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  26.07 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  27.56 
 
 		 272 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  30.21 
 
 		 267 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  26.9 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  26.92 
 
 		 324 aa  89.7  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  28.28 
 
 		 263 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  29.51 
 
 		 260 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  27.36 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  29.15 
 
 		 300 aa  88.6  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  29.1 
 
 		 264 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  27.36 
 
 		 316 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  27.78 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  26.19 
 
 		 338 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  27.13 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  27.27 
 
 		 339 aa  86.7  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  27.55 
 
 		 338 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  28.49 
 
 		 403 aa  86.3  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  25.59 
 
 		 266 aa  86.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  27.55 
 
 		 338 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  27.55 
 
 		 338 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  28.18 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  30.17 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  30.63 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  24.85 
 
 		 270 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  24.26 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  32.89 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  26.22 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  25 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  27.6 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  24.34 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  25.7 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  27.67 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  26.37 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  29.78 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  24.14 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  25.39 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  24.58 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  28.04 
 
 		 233 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  25.39 
 
 		 236 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  26.7 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  23.3 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  24.41 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  22.75 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  24.12 
 
 		 251 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  24.31 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  26.26 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  26.38 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  26.26 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  26.26 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  26.26 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  26.26 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  26.26 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  26.26 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  22.03 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  26.55 
 
 		 251 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  24.75 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  26.05 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  22.56 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  21.84 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  21.84 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  25.29 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  25.51 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  27.39 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  26.74 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  23.5 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  24.85 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  24.12 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  24.12 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  24.12 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  24.12 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  23.78 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  25.73 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  22.77 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  23.17 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  23.91 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  23.17 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  21.51 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  24.6 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  24.05 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  24.6 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  24.6 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  23.17 
 
 		 228 aa  57  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  23.17 
 
 		 228 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  25.73 
 
 		 227 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  22.54 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  25.73 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  21.25 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  27.39 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  21.25 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  22.42 
 
 		 248 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  24.71 
 
 		 241 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>