262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5303 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5303  ribose-5-phosphate isomerase B  100 
 
 
161 aa  323  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430947  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1162  ribose-5-phosphate isomerase B  77.78 
 
 
162 aa  253  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0742632  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7302  ribose-5-phosphate isomerase B  62.03 
 
 
159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160581  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2531  ribose 5-phosphate isomerase  65.79 
 
 
155 aa  209  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3408  ribose 5-phosphate isomerase  66.45 
 
 
155 aa  209  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1356  ribose 5-phosphate isomerase  65.13 
 
 
155 aa  208  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2202  ribose-5-phosphate isomerase B  61.84 
 
 
166 aa  205  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1598  ribose-5-phosphate isomerase B  63.4 
 
 
160 aa  203  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.113376  normal  0.826061 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11660  ribose 5-phosphate isomerase  65.1 
 
 
160 aa  201  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3522  ribose-5-phosphate isomerase B  62.73 
 
 
162 aa  200  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7320  ribose/galactose isomerase  60.53 
 
 
169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3483  ribose-5-phosphate isomerase B  64.74 
 
 
162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3889  ribose-5-phosphate isomerase B  59.48 
 
 
155 aa  191  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.212373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1551  ribose 5-phosphate isomerase  61.18 
 
 
163 aa  191  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12490  ribose-5-phosphate isomerase B  55.62 
 
 
162 aa  191  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1375  ribose 5-phosphate isomerase  62.33 
 
 
150 aa  190  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3514  ribose-5-phosphate isomerase B  59.48 
 
 
155 aa  189  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2620  ribose 5-phosphate isomerase  63.01 
 
 
149 aa  188  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.285539  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1145  ribose 5-phosphate isomerase  59.87 
 
 
161 aa  187  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5443  ribose 5-phosphate isomerase  58.55 
 
 
159 aa  186  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09810  ribose-5-phosphate isomerase B  60.65 
 
 
157 aa  186  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0167583  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09040  ribose 5-phosphate isomerase  59.87 
 
 
153 aa  185  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0154661 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0947  ribose 5-phosphate isomerase  61.64 
 
 
150 aa  185  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1105  ribose 5-phosphate isomerase  60.96 
 
 
152 aa  184  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79146  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24510  ribose 5-phosphate isomerase  60.81 
 
 
149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.893298  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2162  ribose-5-phosphate isomerase B  57.69 
 
 
164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000167121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2408  ribose-5-phosphate isomerase B  57.14 
 
 
164 aa  180  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.683138  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2041  ribose 5-phosphate isomerase  56.33 
 
 
157 aa  179  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1401  ribose 5-phosphate isomerase  55.35 
 
 
160 aa  175  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2581  ribose-5-phosphate isomerase B  55.41 
 
 
157 aa  175  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11900  ribose 5-phosphate isomerase  59.87 
 
 
157 aa  174  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4053  ribose-5-phosphate isomerase B  54.73 
 
 
157 aa  174  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3599  ribose-5-phosphate isomerase B  56.88 
 
 
162 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186156  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3672  ribose-5-phosphate isomerase B  56.88 
 
 
162 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.615114  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3604  ribose-5-phosphate isomerase B  56.88 
 
 
162 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.152341  normal  0.756157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2701  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50 
 
 
143 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  0.215374 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0043  ribose 5-phosphate isomerase B  47.92 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0006  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.26 
 
 
153 aa  122  2e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4198  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  47.86 
 
 
145 aa  122  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335941  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0074  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  41.38 
 
 
165 aa  118  3e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  40.94 
 
 
152 aa  117  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  40.94 
 
 
152 aa  117  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2621  ribose/galactose isomerase  42.28 
 
 
150 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03435  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  41.67 
 
 
143 aa  117  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.97 
 
 
149 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1196  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.61 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0922394  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  39.46 
 
 
154 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  37.58 
 
 
152 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.85 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0792  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.96 
 
 
140 aa  111  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.36 
 
 
143 aa  111  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0217  ribose 5-phosphate isomerase B  40.14 
 
 
152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00182493  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3631  ribose 5-phosphate isomerase B  40.85 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.06 
 
 
152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  40.82 
 
 
322 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  45.58 
 
 
181 aa  107  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.18 
 
 
153 aa  107  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1019  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.55 
 
 
153 aa  107  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1034  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.57 
 
 
146 aa  106  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.257274 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.86 
 
 
149 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1258  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.55 
 
 
144 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000876493  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  42.55 
 
 
149 aa  105  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000182185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.43 
 
 
142 aa  104  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  39.6 
 
 
148 aa  104  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2809  ribose-5-phosphate isomerase B  37.16 
 
 
149 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119147  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.95 
 
 
149 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0934  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  39.73 
 
 
161 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.759422  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2228  ribose 5-phosphate isomerase B  44.68 
 
 
147 aa  103  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000313562  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1117  ribose-5-phosphate isomerase B  36.49 
 
 
150 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2837  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.21 
 
 
147 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0401  ribose/galactose isomerase  40.58 
 
 
149 aa  102  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0557061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2745  ribose-5-phosphate isomerase  45.21 
 
 
147 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.47 
 
 
148 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  38.36 
 
 
148 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1057  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.69 
 
 
148 aa  101  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0654915  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1747  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  44.29 
 
 
145 aa  101  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  39.73 
 
 
149 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  39.73 
 
 
149 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.1 
 
 
149 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1553  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.26 
 
 
147 aa  101  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1307  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.25 
 
 
154 aa  101  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.833866  normal  0.257706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2929  ribose 5-phosphate isomerase B  44.52 
 
 
147 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl105  ribose 5-phosphate isomerase  36.3 
 
 
146 aa  100  7e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21560  ribose-5-phosphate isomerase  39.86 
 
 
146 aa  100  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971955  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  40.85 
 
 
144 aa  100  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.9 
 
 
147 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.86 
 
 
149 aa  100  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  37.16 
 
 
149 aa  100  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  40.82 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.73 
 
 
147 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1446  ribose 5-phosphate isomerase B  44.37 
 
 
144 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.396381  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0889  ribose 5-phosphate isomerase B  39.72 
 
 
145 aa  99  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12150  ribose-5-phosphate isomerase  41.26 
 
 
144 aa  99.4  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40 
 
 
142 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  39.19 
 
 
370 aa  99  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3821  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.58 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0187638  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1359  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.86 
 
 
144 aa  99.4  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2120  ribose-5-phosphate isomerase  40.56 
 
 
146 aa  99  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00298451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0852  ribose 5-phosphate isomerase B  37.67 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00452736  normal  0.320057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  38.03 
 
 
148 aa  98.2  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>